Отдельные бактериальные тела не могут быть эмболами. Как биологические агенты, подвергаясь адсорбции со стороны береговых клеток сосудистой системы, ретикулярной стромы лимфатических узлов и селезенки, они претерпевают различную судьбу: инфекция, бактериолиз или "глухое" пребывание где-либо в тканях. Чаще всего, как это было доказано еще В. К. Высоковичем (1854-1912), бактерии удаляются из крови и уничтожаются, для чего организм располагает широчайшими возможностями.
Бактерии могут вызвать эмболию лишь тогда, когда они агглютинированы или же, размножаясь в белковом субстрате, вместе с последним попадают в кровь и застревают затем в капиллярах какого-либо органа, особенно в легких, создавая тем самым предпосылку для развития метастатического инфекционного очага.
Такой же эффект может быть следствием нестерильных тромбоэмболии, когда частицы подвергшегося гнойному расплавлению тромба попадают в циркулирующую кровь. Наблюдаемые при пиемиях метастатические очаги, особенно в легких, возможно, потому и имеют столь различную величину (милиарные и крупные, инфарктообразные), что в одних случаях они связаны с эмболами, представляющими собой агглютинированные колонии микробов, в других случаях эмболами являются крупные кусочки гнойно расплавленного тромба, приводящие сначала к образованию инфаркта. Способность мягких эмболов распадаться на частицы в токе крови и в момент закупорки создает возможность большого разнообразия величины очагов в одном и том же органе.