Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )
Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных |
alexlp |
16.06.2008 - 21:41
Сообщение
#1 |
Мастер II Группа: СМЭ Регистрация: 14.06.2008 Пользователь №: 8 835 |
Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д. Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip). Загрузить полный пакет библиотек вы можете как со страницы форума, так и с нового сайта проекта SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ sudmed-ms_2832_amdislib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке. sudmed-ms_2832_nistlib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь. SUDMED-MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation) sudmed-ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary - библиотека в формате Agilent MassHunter sudmed-ms_2832_lib_20191231.pdf - индексный список содержимого библиотеки SUDMED-MS_2832_LIB_20191231_new.pdf - сведения об обновлениях SUDMED_MS_SETUP.pdf - инструкция по установке библиотек SUDMED-MS Прикрепленные файлы SUDMED_NNCN_20141108_2.zip ( 14.45 мегабайт ) Кол-во скачиваний: 4023 SUDMED_MS_SETUP.pdf ( 404.04 килобайт ) Кол-во скачиваний: 976 sudmed_ms_2832_lib_20191231.pdf ( 634.57 килобайт ) Кол-во скачиваний: 771 sudmed_ms_2832_amdislib_20191231.zip ( 1.16 мегабайт ) Кол-во скачиваний: 617 SUDMED_MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip ( 1.11 мегабайт ) Кол-во скачиваний: 533 sudmed_ms_2832_nistlib_20191231.zip ( 2.61 мегабайт ) Кол-во скачиваний: 589 sudmed_ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary.zip ( 1.02 мегабайт ) Кол-во скачиваний: 549 sudmed_ms_2832_lib_20191231_NEW.pdf ( 245.63 килобайт ) Кол-во скачиваний: 801 sudmed_ms_2832_lib_20191231_eng.pdf ( 581.64 килобайт ) Кол-во скачиваний: 824 |
Ответов(1 - 14) |
KSS17 |
16.06.2008 - 21:51
Сообщение
#2 |
Мастер I Группа: Модераторы Регистрация: 15.08.2007 Пользователь №: 5 557 |
Здравствуйте!
Тур, тур, тур… Не надо выкладывать фирменные библиотеки. Нам тут ещё не хватало нарушения авторских прав разбирать. Только собственные данные и спектры. Будем корректны. |
alexlp |
16.06.2008 - 22:30
Сообщение
#3 |
Мастер II Группа: СМЭ Регистрация: 14.06.2008 Пользователь №: 8 835 |
Вы абсолютно правы, Коллега!
Не сомневаюсь, что у всех наших коллег есть необходимые им фирменные библиотеки на вполне законных основаниях. Процедура конвертирования из формата .l в .msl достаточно подробно описана в документах "5989-0916EN_build_screener_libraries.pdf" и "5989-2249EN_build_DRS_libraries.pdf" из пакета ПО "Agilent G1716AA Integrated Deconvolution Reporting Software for the MSD Productivity ChemStation" и не представляет трудностей. В данном посте я хочу опубликовать дополнительные файлы, созданные в нашей лаборатории, позволяющие производить поиск по базе PMW_TOX3 в программе AMDIS в режиме "Use RI Calibr.Data", используя индексы удерживания базы данных после калибровки колонки: PMW.isl - внутренние стандарты (опционально) pmw.csl - калибровочные стандарты (калибровка колонки для сопоставления времени удерживания и Индексов удерживания) pmw.cal - таблица калибровки колонки (переписывается в процессе калибровки Вашей колонки в Ваших условиях) pmw.ini - конфигурация АМДИСа. PMW.zip ( 3 килобайт ) Кол-во скачиваний: 1636 |
KSS17 |
17.06.2008 - 20:57
Сообщение
#4 |
Мастер I Группа: Модераторы Регистрация: 15.08.2007 Пользователь №: 5 557 |
Здравствуйте!
Выкладываю масс-спектры дезоморфина и некоторых его производных, для AMDIS. Desomorphine.rar ( 4.98 килобайт ) Кол-во скачиваний: 2119 |
KSS17 |
18.06.2008 - 18:23
Сообщение
#5 |
Мастер I Группа: Модераторы Регистрация: 15.08.2007 Пользователь №: 5 557 |
Здравствуйте!
Выкладываю масс-спектры сибутрамина, производных налидиксовой кислоты, скополамина и его производных, ацетилированного трамадола, зопиклона и производных продукта его гидролиза (в том числе 2-амино-5-хлорпиридина и его ацетильного аддукта), для AMDIS. Drugs1806.rar ( 7.22 килобайт ) Кол-во скачиваний: 1701 |
Zordrak |
11.01.2009 - 21:44
Сообщение
#6 |
Участник форума Группа: Участники Регистрация: 26.05.2008 Пользователь №: 8 611 |
Вашему вниманию представляем демо-версию библиотеки масс-спектров для AMDIS. В ней содержится более 200 спектров. Данный вариант распространяется свободно. Будем признательны за выявленные ошибки и замечания. Замечания можно оставлять здесь. Полный вариант предлагаемой демо-библиотеки содержит абсолютные времена удерживания. Есть так же методика по установке ГХ метода с получением шкалы времён удерживания на колонках нескольких типов. Существует расширенный вариант библиотеки содержащий около 600 спектров (400 соединений с временами удерживания). Обновление и пополнение библиотеки происходит постоянно. ____________ Предупреждение: незначительное нарушение [*] Выдал: Дмитрий Причина: Нарушение пп. 5.5, 7.8.1 правил форума. Истекает: через 1 день |
bell |
5.02.2009 - 12:54
Сообщение
#7 |
Вновь прибывший Группа: Участники Регистрация: 5.02.2009 Пользователь №: 12 609 |
Здравствуйте коллеги.Подскажите где можно скачать amdis и еще много разных поисковиков.
|
alexlp |
5.02.2009 - 13:58
Сообщение
#8 |
Мастер II Группа: СМЭ Регистрация: 14.06.2008 Пользователь №: 8 835 |
Здравствуйте коллеги.Подскажите где можно скачать amdis и еще много разных поисковиков. |
alexlp |
25.03.2009 - 09:05
Сообщение
#9 |
Мастер II Группа: СМЭ Регистрация: 14.06.2008 Пользователь №: 8 835 |
Agilent анонсировал новую базу данных для судебной токсикологии
|
KSS17 |
25.11.2009 - 19:07
Сообщение
#10 |
Мастер I Группа: Модераторы Регистрация: 15.08.2007 Пользователь №: 5 557 |
Здравствуйте!
Для АМДИС масс-спектры нескольких каннабимиметиков… Масс-спектры JWH-018 и JWH-073. А так же масс-спектры гомолога С8 соединения СР-47,497 и его производных (диацетил- и диТМС-). Прикрепленные файлы Cannabimimetics.rar ( 1.73 килобайт ) Кол-во скачиваний: 1650 |
макsим |
26.11.2009 - 18:03
Сообщение
#11 |
Опытный участник Группа: Участники Регистрация: 1.04.2009 Пользователь №: 13 808 |
Спасибо коллеги!!! Только подскажите как этим воспользоваться?
|
KSS17 |
26.11.2009 - 20:00
Сообщение
#12 |
Мастер I Группа: Модераторы Регистрация: 15.08.2007 Пользователь №: 5 557 |
Здравствуйте!
Распаковываете архив в директории Lib проги AMDIS. Запускаете AMDIS, заходите в меню Library, выбираете подменю Library Transfer. В появившемся окне выбираем кнопку Files, в открывшейся панели с левой стороны жмём Load library, выбираем библиотеку с каннабимиметиками, затем в правой части жмем кнопку с тем же названием и выбираем библиотеку, которую пользуете в обиходе. Жмем Close. В правой части окна выбираем компонент и жмем Transfer. Всё, компонент добавлен в Вашу поисковую библиотеку масс-спектров. |
KSS17 |
27.12.2009 - 10:32
Сообщение
#13 |
Мастер I Группа: Модераторы Регистрация: 15.08.2007 Пользователь №: 5 557 |
Здравствуйте!
Масс-спектр нового синтетика 4-метоксифенциклидина (пара-метокси-РСР). Индекс удерживания на колонке НР-5MS - 2212. При ГХ анализе так же свойственен продукт термолиза (он общий для пара-метокси-РСР и трамадола). Прикрепленные файлы pMeOPCP.rar ( 863 байт ) Кол-во скачиваний: 1293 |
KSS17 |
15.02.2010 - 20:03
Сообщение
#14 |
Мастер I Группа: Модераторы Регистрация: 15.08.2007 Пользователь №: 5 557 |
Здравствуйте!
Реальные масс-спектры и индексы удерживания СР-47,497-С8 (для колонки HP-5MS) и его производных (диацетил-, дипентафторпропионил-, монометил-, дитрифторацетат-, дитриметилсилил-). Наибольшую чувствительность дают ТМС производные (изомеры выходят одним пиком), хуже всего метильные производные (пик слегка уширен). Как обычно для АМДИС... Внес поправку в название метильного производного, СР-47,497-С8 даёт в основном монометильное производное (спектры которых приведены в базе для обоих изомеров, исправление коснулось лишь названия производных). Прикрепленные файлы Cannabimimrial.rar ( 5.3 килобайт ) Кол-во скачиваний: 1180 |
макsим |
16.02.2010 - 20:12
Сообщение
#15 |
Опытный участник Группа: Участники Регистрация: 1.04.2009 Пользователь №: 13 808 |
Здравствуйте! Реальные масс-спектры и индексы удерживания СР-47,497-С8 (для колонки HP-5MS) и его производных (диацетил-, дипентафторпропионил-, диметил-, дитрифторацетат-, дитриметилсилил-). Наибольшую чувствительность дают ТМС производные (изомеры выходят одним пиком), хуже всего метильные производные (пик слегка уширен). Как обычно для АМДИС... Уважаемый KSS это вы из биопроб или из травы или просто литературные данные привели? |
Сейчас: 8.11.2024 - 17:03 |