 |
 |
|
|
Форум судебных медиков России > Судебная медицина и судебно-медицинская экспертиза > Аналитическая и судебная токсикология  |
 |
Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных |
Рейтинг
 |  |
| alexlp |
 16.06.2008 - 21:41
Сообщение
#1 (закреплено) |
 |
Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д. Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip). Загрузить полный пакет библиотек вы можете как со страницы форума, так и с нового сайта проекта SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ sudmed-ms_2832_amdislib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке. sudmed-ms_2832_nistlib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь. SUDMED-MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation) sudmed-ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary - библиотека в формате Agilent MassHunter sudmed-ms_2832_lib_20191231.pdf - индексный список содержимого библиотеки SUDMED-MS_2832_LIB_20191231_new.pdf - сведения об обновлениях SUDMED_MS_SETUP.pdf - инструкция по установке библиотек SUDMED-MS Прикрепленные файлы 
SUDMED_NNCN_20141108_2.zip ( 14.45 мегабайт )
Кол-во скачиваний: 4034
SUDMED_MS_SETUP.pdf ( 404.04 килобайт )
Кол-во скачиваний: 1000
sudmed_ms_2832_lib_20191231.pdf ( 634.57 килобайт )
Кол-во скачиваний: 807
sudmed_ms_2832_amdislib_20191231.zip ( 1.16 мегабайт )
Кол-во скачиваний: 625
SUDMED_MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip ( 1.11 мегабайт )
Кол-во скачиваний: 539
sudmed_ms_2832_nistlib_20191231.zip ( 2.61 мегабайт )
Кол-во скачиваний: 595
sudmed_ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary.zip ( 1.02 мегабайт )
Кол-во скачиваний: 556
sudmed_ms_2832_lib_20191231_NEW.pdf ( 245.63 килобайт )
Кол-во скачиваний: 837
sudmed_ms_2832_lib_20191231_eng.pdf ( 581.64 килобайт )
Кол-во скачиваний: 848 |
  |
  
|
 |
 |
Форум судебных медиков России > Судебная медицина и судебно-медицинская экспертиза > Аналитическая и судебная токсикология |
Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных |
Рейтинг
| |
| RedPepper |
26.11.2013 - 15:22
Сообщение
#211 |
|
|
Korvet, а это точно ВСЕ файлы, которые должны быть - ничего не потерялось?
|
|
|
|
|
|
| Korvet |
26.11.2013 - 15:47
Сообщение
#212 |
|
|
не, не потерялось, всю папку с флэшки целиком правой кнопкой заархивил, ранее открывалось в хантере. Пытаемые мною на сей счет сотрудники (agilent) ничего сказать не могут, рекомендовали какой-то триальный софт, но его пока не ставил. сможет ли он конвертировать пока не ясно. вообще это софт обработки данных а не конвертер...похоже это все же не "msxml" формат, на который рассчитан амдис, я тоже заметил что все данные в файле *.bin, может непосредственно его попробовать открыть...
|
|
|
|
|
|
| tihonya |
26.11.2013 - 17:00
Сообщение
#213 |
|
|
Всем доброго дня
товарищи гуру, не подскажите на счет библиотеки Cayman Spectral Library (CSL)? можно ли ей доверять, перечень свеженьких веществ там вроде бы приличный... вот ссылка на нее |
|
|
|
|
|
| Korvet |
26.11.2013 - 18:46
Сообщение
#214 |
|
|
доверять наверное можно, но можно ли ссылаться в официальных документах - едва ли
|
|
|
|
|
|
| KNIISE |
28.11.2013 - 18:46
Сообщение
#215 |
|
|
Цитата(Korvet @ 26.11.2013 - 17:46)  доверять наверное можно, но можно ли ссылаться в официальных документах - едва ли А по мне - можно, также как на всех остальных (при этом расписать их регалии). Кайман обновился: Прикрепленные файлы
CaymanSpectralLibraryHP261113.zip ( 773.87 килобайт )
Кол-во скачиваний: 724
CaymanSpectralLibraryNIST261113.zip ( 329.59 килобайт )
Кол-во скачиваний: 521 |
|
|
|
|
|
| alexlp |
29.11.2013 - 06:32
Сообщение
#216 |
|
|
Цитата(KNIISE @ 28.11.2013 - 21:46) Кайман обновился: Коллеги! Будем переносить в SUDMED новые спектры из Каймана? Какие будут предложения? |
|
|
|
|
|
| Korvet |
29.11.2013 - 11:06
Сообщение
#217 |
|
|
по мне так не стоит, все поисковые программы позволяют цеплять несколько БД...да и так лучше видно будет откуда спектр, если все по отдельности...спектры каймана постоянно обновляются, проще брать их сайта, то же и SWG....
|
|
|
|
|
|
| alexlp |
29.11.2013 - 11:23
Сообщение
#218 |
|
|
Цитата(Korvet @ 29.11.2013 - 14:06) по мне так не стоит, все поисковые программы позволяют цеплять несколько БД...да и так лучше видно будет откуда спектр, если все по отдельности...спектры каймана постоянно обновляются, проще брать их сайта, то же и SWG.... А как к АМДИСУ прикрутить пару библиотек, чтобы использовать его, а не нистовский, алгоритм с начислением пенальти? Я - не знаю. Полагаю, что спектры вновь внесенных в списки, или планируемых к внесению, равно как и метаболиты уже внесенных были бы не лишние в объединенной библиотеке. Пока - только два мнения. ЗЫ: Кстати, SUDMED уже в полтора раза толще Каймана  |
|
|
|
|
|
| KNIISE |
29.11.2013 - 11:58
Сообщение
#219 |
|
|
Цитата(Korvet @ 29.11.2013 - 10:06) по мне так не стоит.... Поддерживаю. Не помню, может уже когда то выкладывал TIAFTовскую фармподборку TMS-производных (когда то была выставлена на их сайте): Прикрепленные файлы
TIAFT2002TMS_HP.rar ( 135.68 килобайт )
Кол-во скачиваний: 295 |
|
|
|
|
|
| Korvet |
29.11.2013 - 19:31
Сообщение
#220 |
|
|
Цитата(Korvet @ 25.11.2013 - 17:20) спасибо! а что-то я все равно не могу открыть файлы от масс-хантера (MZXML format) в амдисе...кто нибудь это умеет делать? способ нашелся!все оказалось проще, оказалось сам масс-хантер может конвертировать в этот самый формат MZXML, а вот этот файл уже может быть открыт в амдисе...странно что я раньше этого не нашел! |
|
|
|
|
|
| alexlp |
17.12.2013 - 10:46
Сообщение
#221 |
|
|
Уважаемые Коллеги!
Располагает ли кто спектрами ТМС метаболитов XLR-11, он же 5-фторированный UR-144? |
|
|
|
|
|
| Korvet |
20.12.2013 - 19:37
Сообщение
#222 |
|
|
гидрокилированный в кольцо метаболит FUB-PB-22, ТМС
|
|
|
|
|
|
| alexlp |
28.12.2013 - 16:04
Сообщение
#223 |
|
|
Уважаемые Коллеги!
Из ранее выложенных хроматограмм Извлечены спектры маркера FUB-PB22 и гидроксилированного метаболита (предположительно) в виде PFP дериватов (дериватизация смесью PFPA+PFPOH) 
ALP_FUBPB22PFP_LIB_20131228.zip ( 42.86 килобайт )
Кол-во скачиваний: 294Обращаюсь к Коллегам с просьбой, при возможности, проверить на MS|MS правильность идентификации гидроксилированного метаболита. Спектр ПФП деривата гирокихинолина будет добавлен аз сун, аз поссибл. В библиотеке онлайн и оффлайн DESIGNER DRUGS 2011 и более свежих этот спектр присутствует как 8-Hydroxyquinoline PFP  |
|
|
|
|
|
| alexlp |
28.12.2013 - 17:11
Сообщение
#224 |
|
|
Уважаемые Коллеги!
Из ранее выложенных хроматограмм Извлечены спектры метаболита M1 AB-CHMINACA в виде PFP деривата (дериватизация смесью PFPA+PFPOH). 
ALP_ABCHMINACAPFP_LIB_20131228.zip ( 27.64 килобайт )
Кол-во скачиваний: 278К сожалению, метаболитов M2 и M3 найти не довелось... |
|
|
|
|
|
| RedPepper |
28.12.2013 - 18:07
Сообщение
#225 |
|
|
Цитата(alexlp @ 28.12.2013 - 17:11) Извлечены спектры метаболита M1 AB-CHMINACA... К сведению, название (введённое, насколько я помню, Nayk'ом) AB-CHMINACA барыги присвоили совершенно ... |
|
|
|
|
|
|
| Сейчас: 16.01.2025 - 06:15 |
© 2002-2017 Форум судебных медиков России
Копирование материалов сайта возможно при условии размещения активной ссылки на источник.
Копирование материалов сайта возможно при условии размещения активной ссылки на источник.