Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

Форум судебных медиков России
41 страниц V « < 14 15 16 17 18 > »   
>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
alexlp
сообщение 16.06.2008 - 21:41
Сообщение #1 (закреплено)


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д.
Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip).

Загрузить полный пакет библиотек вы можете как со страницы форума, так и с нового сайта проекта http://sudmed-ms.my1.ru/

SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ

sudmed-ms_2832_amdislib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке.

sudmed-ms_2832_nistlib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь.

SUDMED-MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation)

sudmed-ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary - библиотека в формате Agilent MassHunter

sudmed-ms_2832_lib_20191231.pdf - индексный список содержимого библиотеки

SUDMED-MS_2832_LIB_20191231_new.pdf - сведения об обновлениях

SUDMED_MS_SETUP.pdf - инструкция по установке библиотек SUDMED-MS

Сообщение отредактировал KSS17 - 1.01.2020 - 18:35


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_NNCN_20141108_2.zip ( 14.45 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  4034
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_MS_SETUP.pdf ( 404.04 килобайт ) Кол-во скачиваний:  1000
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231.pdf ( 634.57 килобайт ) Кол-во скачиваний:  807
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_amdislib_20191231.zip ( 1.16 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  625
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip ( 1.11 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  539
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_nistlib_20191231.zip ( 2.61 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  595
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary.zip ( 1.02 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  556
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231_NEW.pdf ( 245.63 килобайт ) Кол-во скачиваний:  837
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231_eng.pdf ( 581.64 килобайт ) Кол-во скачиваний:  848
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
alexlp
сообщение 28.12.2013 - 18:19
Сообщение #226


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(RedPepper @ 28.12.2013 - 21:07)
К сведению, название (введённое, насколько я помню, Nayk'ом) AB-CHMINACA барыги присвоили совершенно другому веществу...

А я был уверен, что это абревиатуры:
AB - амид валина
CHM - циклогексилметил
INACA - индазолкарбоксамид

Ну и далее по списку аналогично

P- пентил
A - адамантан
FUB - он и есть - ФУБ...
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KSS17
сообщение 28.12.2013 - 18:40
Сообщение #227


Мастер I
Group Icon
Группа: Модераторы
Регистрация: 15.08.2007
Пользователь №: 5 557


Здравствуйте!

Масс-спектры производных некоторых метаболитов РВ-22, РВ-22F, AB-CHMINACA, AB-FUBINACA, AB-PINACA, FUB-PB-22. Метильные производные, ТМС-производные и смешанные эфиры...

На барыг лучше не ориентироваться, они как хотят так и называют, причём иногда и не зная чего... smile.gif

Маркетинг, так сказать.


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  CanMetab12.rar ( 9.18 килобайт ) Кол-во скачиваний:  311
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 28.12.2013 - 18:51
Сообщение #228


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Уважаемые Коллеги!

Из ранее выложенных хроматограмм http://www.sudmed.ru/index.php?showtopic=1...amp;st=45&#
Извлечены спектры метаболита M1 и M2 AB-PINACA в виде PFP деривата (дериватизация смесью PFPA+PFPOH).
Судебная медицина - Прикрепленное изображение
Судебная медицина - Прикрепленный файл  ALP_ABPINACAPFP_LIB_20131228.zip ( 40.64 килобайт ) Кол-во скачиваний:  339
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 28.12.2013 - 19:09
Сообщение #229


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Уважаемые Коллеги!

Из ранее выложенных хроматограмм http://www.sudmed.ru/index.php?showtopic=1...amp;st=45&#
Извлечены спектры метаболита M1 AB-FUBINACA в виде PFP деривата (дериватизация смесью PFPA+PFPOH).
Судебная медицина - Прикрепленное изображение
Судебная медицина - Прикрепленный файл  ALP_ABFUBINACAPFP_LIB_20131228.zip ( 35.1 килобайт ) Кол-во скачиваний:  313


Сообщение отредактировал alexlp - 28.12.2013 - 19:24
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 1.01.2014 - 14:04
Сообщение #230


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


УВАЖАЕМЫЕ КОЛЛЕГИ!

От всей души поздравляю всех с наступившим 2014 годом!

Обновлена сборка нашей сводной библиотеки SUDMED. Теперь она включает 817 спектров, любезно предоставленных нашими Коллегами.
В эту сборку включены дополнительные спектры серии CP-47,497, серии AB-...INACA и FUB-PB22, выложенные KSS17, ТМС маркер гидроксилированного метаболита FUB-PB22, выложенный Korvet, и ПФП дериваты AB-...INACA и FUB-PB22:

768 CP-47,497-C8 isomer, diacetyl-
769 CP-47,497-C8 isomer, diPFP-
770 CP-47,497-C8 isomer, diTFA- 771 CP-47,497-C8, di-TMS-
772 CP-47,497-C8, diacetyl-
773 CP-47,497-C8, diPFP-
774 CP-47,497-C8, diTFA-
775 CP47,497-C8
776 CP47,497-C8 isomer
777 CP-47,497-C8 isomer, methyl-
778 CP-47,497-C8, methyl-
779 FUB-PB-22-ACID-OH-TMS
780 AB-FUBINACA M (...indazol-3-carbonic acid), methyl-
781 AB-FUBINACA M1, bis-TMS-
782 AB-FUBINACA M1, methyl-, N-TMS-
783 AB-FUBINACA M2 (Indazol-OH), dimethy-
784 AB-FUBINACA M2 (Indazol-OH), methy-, acetyl-
785 AB-FUBINACA, bis-TMS-
786 PB-22 M2 (COOCH3, OTMS)
787 PB-22 M2 diTMS
788 PB-22 M2 methyl-
789 PB-22 M2 methyl- acetyl-
790 PB-22 M3 methyl-
791 PB-22 M3 TMS
792 PB-22 M4 (Alk-COOH), dimethyl-
793 PB-22 M5 (di-OH), dimethyl-
794 PB-22F M2 (alk-OH) diTMS
795 PB-22F M2 (alk-OH) methyl-
796 PB-22F M3 (des-F, COOH) dimethyl-
797 PB-22F M3 (des-F, COOH) diTMS
798 PB-22F M4 (Aryl-OH) dimethyl-
799 AB-CHMINACA M2 (3-COOH), methyl-
800 AB-CHMINACA M3 (OH), diTMS-
801 AB-CHMINACA M3 (OH), methyl-
802 AB-CHMINACA M3 (OH), methyl-, O-acetyl-
803 AB-CHMINACA M4 (2'-OH), methyl- O-acetyl-
804 AB-CHMINACA M4 (2'-OH), metyl-
805 AB-PINACA-M6 (3-COOH), methyl-
806 AB-PINACA-M5 (4-OH alk), methyl-
807 FUB-PB-22 M1 (marker), ethyl-
808 FUB-PB-22 M2, dimethyl-
809 FUB-PB-22 M2, diTMS
810 FUB-PB-22 M2, monomethyl-
811 FUB-PB-22 M2, PFPA/PFPOH
812 AB-CHMINACA M1 (marker), PFP-
813 AB-FUBINACA M1 PFP-
814 AB-PINACA-M1 (COOH), PFP-
815 AB-PINACA-M2 (COOH, oxo=), PFP-
816 ??? FUB-PB-22 M-OH PFP ???
817 FUB-PB-22 marker PFP


Сообщение отредактировал alexlp - 1.01.2014 - 16:32
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KNIISE
сообщение 16.01.2014 - 22:02
Сообщение #231


Продвинутый участник

Группа: Участники
Регистрация: 16.03.2010
Пользователь №: 20 614


SWGDRUG приняли последние Каймановские обновы biggrin.gif
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KSS17
сообщение 29.01.2014 - 19:36
Сообщение #232


Мастер I
Group Icon
Группа: Модераторы
Регистрация: 15.08.2007
Пользователь №: 5 557


Здравствуйте!

Спектрики под АМДИС. 5F-AMB он же может выступать как метилированный маркер FAB-144. При анализе мочи, после метилирования мы получаем исходный 5F-AMB... smile.gif За эти данные большое спасибо ув. Корвету и его коллегам.
И ещё новиночка SDB-006.

Индексы корректны для 5F-AMB (он же метилированный маркер FAB144 / 5F-AMB) и SDB-006.


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  Spice201401.zip ( 1.77 килобайт ) Кол-во скачиваний:  281
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 31.01.2014 - 05:32
Сообщение #233


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(KSS17 @ 29.01.2014 - 22:36)

И ещё новиночка SDB-006.

Таких зверушек еще не бывало...

Судебная медицина - Прикрепленное изображение

SDB-006 NEW
Cayman Chemical Item Number 15156

(CAS 695213-59-3)

Description
SDB-006 is a cannabimimetic indole that binds the cannabinoid central cannabinoid (CB1) and peripheral cannabinoid (CB2) receptors with EC50 values of 19 and 134 nM, respectively.1 It was discovered during research of the related compound JWH 018 adamantyl carboxamide (Item No. 9001193), which has been sold illicitly in herbal blends.1 This product is intended for research and forensic applications.
Formal Name 1-​pentyl-​N-​(phenylmethyl)-​1H-​indole-​3-​carboxamide
CAS Number 695213-59-3
Molecular Formula C21H24N2O
Formula Weight 320.4
Formulation A crystalline solid
Purity ≥98%
λmax 218, 291 nm
Stability 2 years
Storage -20°C
Shipping Room temperature in continental US; may vary elsewhere
SMILES CCCCCN1C=C(C(NCC2=CC=CC=C2)​=O)​C3=C1C=CC=C3
InCHI Code ​1S/C21H24N2O/c1-2-3-9-14-23-16-19(18-12-7-8-13-20(18)​23)​21(24)​22-15-17-10-5-4-6-11-17/h4-8,10-13,16H,2-3,9,14-15H2,1H3,(H,22,24)​
InCHI Key OLACYTSBFXCDOH-UHFFFAOYSA-N

https://www.caymanchem.com/app/template/Pro...m/catalog/15156

Сообщение отредактировал alexlp - 31.01.2014 - 09:18
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 31.01.2014 - 09:17
Сообщение #234


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Уважаемые Коллеги!
В нашей библиотеке отсутствуют спектры метаболитов AM2201 (5F-JWH018). Может у кого завалялись хроматограммки?
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Korvet
сообщение 3.02.2014 - 19:21
Сообщение #235


Магистр форума

Группа: СМЭ
Регистрация: 13.05.2009
Из: Томск
Пользователь №: 14 703


хроматограммка-то есть, только найти на ней что-то уникальное именно для ам-2201 я не могу, может у Вас получится. единственное отличие от картины, наблюдающейся для 018-го - наличие С5-карбокси метаболита, также пичок jwh-073 C4-OH

http://yadi.sk/d/bvC6GNJqHF6wo.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KNIISE
сообщение 7.02.2014 - 19:32
Сообщение #236


Продвинутый участник

Группа: Участники
Регистрация: 16.03.2010
Пользователь №: 20 614


Онлайн симулирование ЯМР-спектров NMR Predictor на ангельскомsmile.gif
А SWGDRUG стали публиковать базы ИК-спектров.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Korvet
сообщение 10.02.2014 - 21:13
Сообщение #237


Магистр форума

Группа: СМЭ
Регистрация: 13.05.2009
Из: Томск
Пользователь №: 14 703


На выходных попалось 2 кролика с индазольным аналогом АМ-2201.
во вложении хроматограмма и 3 метаболита. пока полностью аналогичны тем что были найдены для АМ-2201. В качестве критерия поиска по прежнему вторичная фрагментация общих (с нативным веществом) ионов

http://yadi.sk/d/o0Hjz--mHfBNu

Если кто найдет на хр-ме иные метаболиты, сообщие будем их рассматривать под микроскопом (мс-мс).

завтра поспеют опарыши, посмотрим чего у них напреет!



Сообщение отредактировал Korvet - 10.02.2014 - 21:13
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 10.02.2014 - 21:42
Сообщение #238


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(Korvet @ 11.02.2014 - 00:13)
На выходных попалось 2 кролика с индазольным аналогом АМ-2201.
во вложении хроматограмма и 3 метаболита. пока полностью аналогичны тем что были найдены для АМ-2201. В качестве критерия поиска по прежнему вторичная фрагментация общих (с нативным веществом) ионов

http://yadi.sk/d/o0Hjz--mHfBNu

Если кто найдет на хр-ме иные метаболиты, сообщие будем их рассматривать под микроскопом (мс-мс).

завтра поспеют опарыши, посмотрим чего у них напреет!


ВОТ СПАСИБО, КОЛЛЕГА!

Ваша хроматограмма неплохо совпала с ранее сконструированными спектрами!
5-карбокси,
Судебная медицина - Прикрепленное изображение
и, видимо, 5-гидрокси(в данном случае он идентифицирован как 4-гидрокси THJ018):
Судебная медицина - Прикрепленное изображение

Завтра все отшлифуем - и в сводную!


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  THJ_008_LIB_20131110.zip ( 31.02 килобайт ) Кол-во скачиваний:  267
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 10.02.2014 - 21:51
Сообщение #239


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


А прометилировать сможете? Или образец выслать?
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 10.02.2014 - 21:58
Сообщение #240


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


И все же что у них изъяли: THJ018 или THJ2201?
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

41 страниц V « < 14 15 16 17 18 > » 



- Обратная связь Сейчас: 16.01.2025 - 07:57