Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

Форум судебных медиков России
41 страниц V « < 16 17 18 19 20 > »   
>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
alexlp
сообщение 16.06.2008 - 21:41
Сообщение #1 (закреплено)


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д.
Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip).

Загрузить полный пакет библиотек вы можете как со страницы форума, так и с нового сайта проекта http://sudmed-ms.my1.ru/

SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ

sudmed-ms_2832_amdislib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке.

sudmed-ms_2832_nistlib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь.

SUDMED-MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation)

sudmed-ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary - библиотека в формате Agilent MassHunter

sudmed-ms_2832_lib_20191231.pdf - индексный список содержимого библиотеки

SUDMED-MS_2832_LIB_20191231_new.pdf - сведения об обновлениях

SUDMED_MS_SETUP.pdf - инструкция по установке библиотек SUDMED-MS

Сообщение отредактировал KSS17 - 1.01.2020 - 18:35


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_NNCN_20141108_2.zip ( 14.45 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  4034
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_MS_SETUP.pdf ( 404.04 килобайт ) Кол-во скачиваний:  1000
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231.pdf ( 634.57 килобайт ) Кол-во скачиваний:  807
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_amdislib_20191231.zip ( 1.16 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  625
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip ( 1.11 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  539
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_nistlib_20191231.zip ( 2.61 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  595
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary.zip ( 1.02 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  556
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231_NEW.pdf ( 245.63 килобайт ) Кол-во скачиваний:  837
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231_eng.pdf ( 581.64 килобайт ) Кол-во скачиваний:  848
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
hot_assay
сообщение 5.03.2014 - 16:34
Сообщение #256


Продвинутый участник

Группа: Участники
Регистрация: 10.07.2008
Из: Ярославль
Пользователь №: 9 065


Цитата(KSS17 @ 17.02.2014 - 08:05)
Здравствуйте!

Обновление будет выложено после внесения исправлений... rolleyes.gif


внесение исправлений ещё не завершено? rolleyes.gif
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Korvet
сообщение 5.03.2014 - 16:37
Сообщение #257


Магистр форума

Группа: СМЭ
Регистрация: 13.05.2009
Из: Томск
Пользователь №: 14 703


спасибо! сделаем пакетный поиск по периоду когда оно широко шло (декабрь 2012-февраль 2013)...может и цапанем чего.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 5.03.2014 - 17:39
Сообщение #258


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(hot_assay @ 5.03.2014 - 19:34)
внесение исправлений ещё не завершено? rolleyes.gif

KSS17, Korvet ??
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Korvet
сообщение 5.03.2014 - 19:03
Сообщение #259


Магистр форума

Группа: СМЭ
Регистрация: 13.05.2009
Из: Томск
Пользователь №: 14 703


ну я вроде послал свои соображения.

1. предлагаю 5F-AMB называть так как он уже вошел в базы данных криминалистов
индольный собрат будет называтся MMB-2201, индазольный будет MMB(N)-2201.

Мethyl 2-[1-(5-fluoropentyl)-1H-indol-3-ylcarboxamido]-3-methylbutanoate

2. соответсвенно метаболиты (продукты гидролиза) например MMB-2201 - carboxy
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 5.03.2014 - 19:04
Сообщение #260


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(Korvet @ 5.03.2014 - 22:03)
ну я вроде послал свои соображения.

1. предлагаю 5F-AMB называть так как он уже вошел в базы данных криминалистов
индольный собрат будет называтся MMB-2201, индазольный будет MMB(N)-2201.

Мethyl 2-[1-(5-fluoropentyl)-1H-indol-3-ylcarboxamido]-3-methylbutanoate

2. соответсвенно метаболиты (продукты гидролиза) например MMB-2201 - carboxy


Я - за унификацию. KSS17?
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 9.03.2014 - 09:12
Сообщение #261


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(hot_assay @ 5.03.2014 - 19:34)
внесение исправлений ещё не завершено? rolleyes.gif


Уважаемые Коллеги!

Наша сводная библиотека расширилась на 129 спектров:

818 SDB-006
819 (E)-4-Chloro-N-(1-(4-nitrophenylethyl)piperidin-2-ylidene)sulfonamide
820 W-15
821 Naphthalene, 1-methoxy-
822 Silane, trimethyl(1-naphthalenyloxy)-
823 XLR11 M28 (-COOH) degradan2cyclo Me
824 XLR11 M27 (-COOH) degradant Me
825 XLR11 M28 (-COOH) degradant Me
826 XLR11 M28 (-COOH) degradant TMS
827 5-fluoro-AKB48 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
828 AB-PINACA N-(5-hydroxypentyl) metabolite
829 AKB48 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
830 AKB48 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
831 AM2201 5-hydroxyindole metabolite
832 AM2201 6-hydroxyindole metabolite
833 AM2201 7-hydroxyindole metabolite
834 AM2201 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
835 Buphedrone metabolite
836 JWH 018 N-(4-oxo-pentyl) metabolite
837 JWH-018 N-(2-hydroxypentyl) metabolite
838 JWH-018 N-(3-hydroxypentyl) metabolite
839 JWH-018 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
840 JWH-018 N-(5-hydroxypentyl) metabolite 841 JWH-019 5-hydroxyindole metabolite
842 JWH-019 N-(5-hydroxyhexyl) metabolite
843 JWH-019 N-(6-hydroxyhexyl) metabolite
844 JWH-073 2-hydroxyindole metabolite
845 JWH-073 N-(2-hydroxybutyl) metabolite
846 JWH-073 N-(3-hydroxybutyl) metabolite
847 JWH-073 N-(4-hydroxybutyl) metabolite
848 JWH-081 4-hydroxynaphthyl metabolite
849 JWH-081 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
850 JWH-081 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
851 JWH-122 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
852 JWH-122 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
853 JWH-200 4-hydroxyindole metabolite
854 JWH-200 5-hydroxyindole metabolite
855 JWH-200 6-hydroxyindole metabolite
856 JWH-200 7-hydroxyindole metabolite
857 JWH-203 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
858 JWH-203 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
859 JWH-210 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
860 JWH-210 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
861 JWH-250 5-hydroxyindole metabolite
862 JWH-250 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
863 JWH-250 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
864 JWH-398 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
865 MDPV metabolite
866 Normephedrone
867 RCS-4 4-hydroxyphenyl metabolite
868 RCS-4 M10 Metabolite
869 RCS-4 M11 metabolite
870 RCS-4 M9 metabolite
871 RCS-4 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
872 RCS-4 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
873 UR-144 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
874 XLR11 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
875 α-Pyrrolidinopentiophenone metabolite
876 (±)-JWH 018 N-(2-hydroxypenyl) metabolite
877 (±)-JWH 018 N-(3-hydroxypentyl) metabolite
878 (±)-JWH 018 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
879 (±)-UR-144 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
880 5-fluoro-AKB48 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
881 a-Pyrrolidinopentiophenone metabolite 1
882 AB-PINACA N-(5-hydroxypentyl) metabolite
883 AKB48 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
884 AKB48 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
885 JWH 018 N-(4-oxo-pentyl) metabolite
886 JWH 018 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
887 JWH 019 5-hydroxyindole metabolite
888 JWH 019 N-(5-hydroxyhexyl) metabolite
889 JWH 019 N-(6-hydroxyhexyl) metabolite
890 JWH 073 2-hydroxyindole metabolite
891 JWH 073 N-(2-hydroxybutyl) metabolite
892 JWH 073 N-(3-hydroxybutyl) metabolite
893 JWH 073 N-(4-hydroxybutyl) metabolite
894 JWH 081 4-hydroxynaphthyl metabolite
895 JWH 081 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
896 JWH 081 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
897 JWH 122 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
898 JWH 122 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
899 JWH 200 4-hydroxyindole metabolite
900 JWH 200 5-hydroxyindole metabolite
901 JWH 200 6-hydroxyindole metabolite
902 JWH 200 7-hydroxyindole metabolite
903 JWH 203 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
904 JWH 203 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
905 JWH 210 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
906 JWH 210 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
907 JWH 250 5-hydroxyindole metabolite
908 JWH 250 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
909 JWH 250 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
910 JWH 398 N-(4-hydroxypentyl) metabolite 911 JWH-018 N-(5-hydroxypentyl) metabolite-d5
912 MDPV metabolite 2
913 JWH-022(indazol)$$$3-(1-Naphthoyl)-1-(pent-4-enyl)indazol$$$(InChI=1/C24H21NO/c1-2-3-8-16-25-17-22(20-13-6-7-15-23(20)25)24(26)21-14-9-11-18-10-4-5-12-19(18)21/h2,4-7,9-15,17H,1,3,8,16H2)
914 JWH-018(indazol) N-(5-hydroxypentyl) metabolite$$$InChI=1/C23H22N2O2/c26-16-7-1-6-15-25-21-14-5-4-12-20(21)22(24-25)23(27)19-13-8-10-17-9-2-3-11-18(17)19/h2-5,8-14,26H,1,6-7,15-16H2
915 AM(indazol)-2201-C5-chain-OH-TMS-iso-3$$
916 AM(indazol)-2201-C5-chain-OH-TMS-iso-2$$
917 AM(indazol)-2201-C5-chain-OH-TMS-iso1$$
918 AM(indazol)-2201-C5-chain-OH-TMS-iso-4$$
919 JWH-018(Indazol)-5OH-TMS
920 JWH-018(Indazole)-5-OH-TMS$$InChI=1/C26H30N2O2Si/c1-31(2,3)30-19-10-4-9-18-28-24-17-8-7-15-23(24)25(27-28)26(29)22-16-11-13-20-12-5-6-14-21(20)22/h5-8,11-17H,4,9-10,18-19H2,1-3H3
921 JWH-018(Indazole)-5-COOH-TMS$$InChI=1/C26H28N2O3Si/c1-32(2,3)31-24(29)17-8-9-18-28-23-16-7-6-14-22(23)25(27-28)26(30)21-15-10-12-19-11-4-5-13-20(19)21/h4-7,10-16H,8-9,17-18H2,1-3H3
922 THJ2201-M5 (-COOH) Me
923 THJ2201-M5 (-COOH) TMS
924 THJ2201-M1 (5-OH) TMS
925 THJ2201-M (-C2-COOH) TMS
926 THJ2201-M (C2-COOH) Me
927 Quinoline, 8-methoxy-
928 AKB48-M1-TMS
929 THJ-2201 M2 (-F, COOH), TMS
930 THJ-2201 M1 (-C2H4F, COOH), TMS-
931 AM-2201 (-C2H4F, 3-COOH), methyl-
932 THJ-2201-M2 (-F, Alk-COOH), methyl-
933 THJ-2201-M1 (-C2H4F, COOH), methyl-
934 THJ-2201-M4 (-F, Alk-4-en, indazol-OH), methyl-
935 5F-AB-PINACA -M marker, methyl-
936 XLR11 M28 # UR-144 # TMCP-018, N-pentanoic acid metabolite, methyl- (thermal isomer)
937 XLR11 (-F, COOH) degradant, methyl-
938 XLR11 (-C2H4F, 3-COOH) # UR-144 M (-C2H4, 3-COOH) thermoisomer, methyl-
939 XLR11 M28 # UR-144 # TMCP-018, N-pentanoic acid metabolite, methyl-
940 MMB-2201
941 MMB-2201 M (-COOH) TMS
942 MMB-2201 marker, TMS-
943 MMB-2201 marker, ethyl-
944 MMB-2201 marker, di-TMS-
945 MMB-2201 / MMB-2201 marker, metyl-
946 MMB-2201


Из них 86 спектров - это спектры нативных метаболитов каннабимиметиков из библиотек Cayman и SWG (содержащие ссылки на источник спектра) Судебная медицина - Прикрепленный файл  saymanswg_metabolites.pdf ( 13.79 килобайт ) Кол-во скачиваний:  868

Картинки имеющихся структур всех добавленных соединений - тут: Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_946_NISTLIB_20140308_new_structures.pdf ( 52 килобайт ) Кол-во скачиваний:  642

Список всех вновь добавленных спектров- тут:Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_946_NISTLIB_20140308_new.pdf ( 18.58 килобайт ) Кол-во скачиваний:  681


Дополнительно включены спектры метильных и ТМС эфиров нафтола, который может быть обнаружен в экстрактах после гидролиза таких соединений, как FDU-PB22 и его производных, а так же спектр Quinoline, 8-methoxy-.

Если вы выявили неточности, ошибки в спектрах - пожалуйста сообщите об этом или в этой ветке, или в ЛС.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
hot_assay
сообщение 10.03.2014 - 09:53
Сообщение #262


Продвинутый участник

Группа: Участники
Регистрация: 10.07.2008
Из: Ярославль
Пользователь №: 9 065


Огромное спасибо!
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
hot_assay
сообщение 13.03.2014 - 06:47
Сообщение #263


Продвинутый участник

Группа: Участники
Регистрация: 10.07.2008
Из: Ярославль
Пользователь №: 9 065


странноватый спектр unsure.gif
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KSS17
сообщение 13.03.2014 - 07:04
Сообщение #264


Мастер I
Group Icon
Группа: Модераторы
Регистрация: 15.08.2007
Пользователь №: 5 557


Здравствуйте!
Да, потерян 109 ион, он 100% в спектре (ион 282 имеет 45%). Видимо пик вещества был перегружен.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
hot_assay
сообщение 13.03.2014 - 07:16
Сообщение #265


Продвинутый участник

Группа: Участники
Регистрация: 10.07.2008
Из: Ярославль
Пользователь №: 9 065


Цитата(KSS17 @ 13.03.2014 - 08:04)
Здравствуйте!
Да, потерян 109 ион, он 100% в спектре (ион 282 имеет 45%). Видимо пик вещества был перегружен.

именно это я и имел в виду wink.gif
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 13.03.2014 - 07:19
Сообщение #266


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(Korvet @ 5.03.2014 - 19:37)
спасибо! сделаем пакетный поиск по периоду когда оно широко шло (декабрь 2012-февраль 2013)...может и цапанем чего.

Удалось ли что нибудь зацепить?
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 13.03.2014 - 08:18
Сообщение #267


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(KSS17 @ 13.03.2014 - 10:04)
Здравствуйте!
Да, потерян 109 ион, он 100% в спектре (ион 282 имеет 45%). Видимо пик вещества был перегружен.


Пока могу предложить такой Судебная медицина - Прикрепленное изображение
Судебная медицина - Прикрепленный файл  FUB_PB_22_M_TMS.zip ( 431 байт ) Кол-во скачиваний:  308
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
макsим
сообщение 13.03.2014 - 15:17
Сообщение #268


Опытный участник

Группа: Участники
Регистрация: 1.04.2009
Пользователь №: 13 808


Уважаемые коллеги. По данным УФСКН в нашем регионе ходит некий спайс они называют его BIM-2201. В имеющихся у меня библиотеках я его под таким название не нашел. может есть более распространенное название. есть нативный масс-спектр и формула. Может кто встречал эту бяку? Хотелось бы также узнать какие метаболиты ожидать и каков будет их масс-спектр TMS производных?

Спасибо!!!


Эскизы прикрепленных изображений
Судебная медицина - Прикрепленное изображение
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 13.03.2014 - 15:22
Сообщение #269


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(макsим @ 13.03.2014 - 18:17)
Уважаемые коллеги. По данным УФСКН в нашем регионе ходит некий спайс они называют его BIM-2201. В имеющихся у меня библиотеках я его под таким название не нашел. может есть более распространенное название. есть нативный масс-спектр и формула. Может кто встречал эту бяку? Хотелось бы также узнать какие метаболиты ожидать и каков будет их масс-спектр TMS производных?

Спасибо!!!


в каймане он числится как бензимидазольный аналог AM2201. Постарайтесь получить мочу потребителей. У нас тож такой изымали.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
xim
сообщение 13.03.2014 - 16:22
Сообщение #270


Вновь прибывший

Группа: Участники
Регистрация: 13.03.2014
Пользователь №: 39 108


Здравствуйте, alexlp, я новичок на данном сайте!!! Как можно скинуть доступную библиотеку JWH? Как производится пробоподготовка, если дериватизация у нас лишь МВТФА?

Сообщение отредактировал xim - 13.03.2014 - 16:24
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

41 страниц V « < 16 17 18 19 20 > » 



- Обратная связь Сейчас: 16.01.2025 - 11:05