 |
 |
|
|
Форум судебных медиков России > Судебная медицина и судебно-медицинская экспертиза > Аналитическая и судебная токсикология  |
 |
Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных |
Рейтинг
 |  |
| alexlp |
 16.06.2008 - 21:41
Сообщение
#1 (закреплено) |
 |
Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д. Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip). Загрузить полный пакет библиотек вы можете как со страницы форума, так и с нового сайта проекта SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ sudmed-ms_2832_amdislib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке. sudmed-ms_2832_nistlib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь. SUDMED-MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation) sudmed-ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary - библиотека в формате Agilent MassHunter sudmed-ms_2832_lib_20191231.pdf - индексный список содержимого библиотеки SUDMED-MS_2832_LIB_20191231_new.pdf - сведения об обновлениях SUDMED_MS_SETUP.pdf - инструкция по установке библиотек SUDMED-MS Прикрепленные файлы 
SUDMED_NNCN_20141108_2.zip ( 14.45 мегабайт )
Кол-во скачиваний: 4034
SUDMED_MS_SETUP.pdf ( 404.04 килобайт )
Кол-во скачиваний: 1000
sudmed_ms_2832_lib_20191231.pdf ( 634.57 килобайт )
Кол-во скачиваний: 807
sudmed_ms_2832_amdislib_20191231.zip ( 1.16 мегабайт )
Кол-во скачиваний: 625
SUDMED_MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip ( 1.11 мегабайт )
Кол-во скачиваний: 539
sudmed_ms_2832_nistlib_20191231.zip ( 2.61 мегабайт )
Кол-во скачиваний: 595
sudmed_ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary.zip ( 1.02 мегабайт )
Кол-во скачиваний: 556
sudmed_ms_2832_lib_20191231_NEW.pdf ( 245.63 килобайт )
Кол-во скачиваний: 837
sudmed_ms_2832_lib_20191231_eng.pdf ( 581.64 килобайт )
Кол-во скачиваний: 848 |
  |
  
|
 |
 |
Форум судебных медиков России > Судебная медицина и судебно-медицинская экспертиза > Аналитическая и судебная токсикология |
Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных |
Рейтинг
| |
| Korvet |
13.03.2014 - 16:23
Сообщение
#271 |
|
|
Цитата(alexlp @ 13.03.2014 - 07:19)  Удалось ли что нибудь зацепить? Увы, но нет...вероятно потому что архив хроматограмм доступен с марта 2013, а он к этому времени уже перестал у нас встречаться. а более древние хр-мы наверное уже удалены... |
|
|
|
|
|
| alexlp |
13.03.2014 - 16:27
Сообщение
#272 |
|
|
Цитата(макsим @ 13.03.2014 - 18:17) Хотелось бы также узнать какие метаболиты ожидать и каков будет их масс-спектр TMS производных? Я полагаю, что метаболизм не будет существенно отличаться от THJ2201. На первом этапе метаболиты должны ловиться на спектры метаболитов THJ2201. Можно попробовать сконструировать библиотечку со сдвинутыми массами молекулярных ионов. На досуге - попробую сделать.... |
|
|
|
|
|
| alexlp |
13.03.2014 - 16:36
Сообщение
#273 |
|
|
Цитата(xim @ 13.03.2014 - 19:22) Здравствуйте, alexlp, я новичок на данном сайте!!! Как можно скинуть доступную библиотеку JWH? Как производится пробоподготовка, если дериватизация у нас лишь МВТФА? К сожалению, в библиотеке SUDMED практически нет спектров ТФА-дериватов... Вот ссылка на информационные письма по анализу синтетики и каннабимиметиков: |
|
|
|
|
|
| KSS17 |
13.03.2014 - 17:36
Сообщение
#274 |
|
|
Здравствуйте!
Цитата(xim @ 13.03.2014 - 18:22) Как можно скинуть доступную библиотеку JWH? Вы на ФСМ хотите скинуть или с ФСМ загрузить? Если загрузить на сайт и у Вас пока нет доступа к загрузке, делается через файлообменник и дается ссылка на файл. Цитата(xim @ 13.03.2014 - 18:22) Как производится пробоподготовка, если дериватизация у нас лишь МВТФА? От получения трифторацильных производных в анализе спайсов отказались даже авторы скрининга с применением ТФУА. Кроме того, более перспективными аналитами в анализе канабимиметиков являются карбоксильные метаболиты (это моё мнение). |
|
|
|
|
|
| alexlp |
13.03.2014 - 17:49
Сообщение
#275 |
|
|
Цитата(KSS17 @ 13.03.2014 - 20:36) От получения трифторацильных производных в анализе спайсов отказались даже авторы скрининга с применением ТФУА. Кроме того, более перспективными аналитами в анализе канабимиметиков являются карбоксильные метаболиты (это моё мнение). Но, надо признать, что идея использования ПФПА+ПФПОН не лишена здравого смысла именно с точки зрения универсальности в дериватизации как карбокси, так и гидрокси метаболитов.... Цитата(alexlp @ 13.03.2014 - 20:46) Но, надо признать, что идея использования ПФПА+ПФПОН не лишена здравого смысла именно с точки зрения универсальности в дериватизации как карбокси, так и гидрокси метаболитов.... Ну это грустные мысли того, у которого закончились силирующие реагенты...  |
|
|
|
|
|
| alexlp |
15.03.2014 - 20:51
Сообщение
#276 |
|
|
Уважаемые Коллеги!
Очередная сборка SUDMED_952_AMDISLIB_20140313: 947 JWH-018(N) (dealkyl-HO-indazol) isomer-di TMS Ether$$$(hydroxy-1H-indazol-3-yl)(naphthalen-1-yl)methanone -di TMS Ether 948 JWH-018(N) (dealkyl-HO-indazol) isomer-2 -di TMS Ether$$$(hydroxy-1H-indazol-3-yl)(naphthalen-1-yl)methanone di TMS Ether 949 JWH-018(N) dealkyl-HO-naphtyl isomer-1 di TMS Ether$$$ 950 JWH-018(N) dealkyl-HO-naphtoyl isomer-2 di TMS Ether 951 JWH-018(N) (dealkyl-HO-indazol) isomer-3 di TMS Ether$$$(hydroxy-1H-indazol-3-yl)(naphthalen-1-yl)methanone di TMS Ether 952 FUB-PB-22 marker TMS Если вы выявили неточности, ошибки в спектрах - пожалуйста сообщите об этом или в этой ветке, или в ЛС. |
|
|
|
|
|
| xim |
16.03.2014 - 16:01
Сообщение
#277 |
|
|
Цитата(alexlp @ 13.03.2014 - 16:36) К сожалению, в библиотеке SUDMED практически нет спектров ТФА-дериватов... Спасибо за отзывчивость и информационные письма!!! |
|
|
|
|
|
| hot_assay |
17.03.2014 - 14:48
Сообщение
#278 |
|
|
Не могу разобраться с AM(indazol)-2201...
 буду благодарен за структурную формулу данного соединения! |
|
|
|
|
|
| alexlp |
17.03.2014 - 15:13
Сообщение
#279 |
|
|
Цитата(hot_assay @ 17.03.2014 - 17:48) Не могу разобраться с AM(indazol)-2201... буду благодарен за структурную формулу данного соединения! THJ 2201 NEW Cayman Chemical Item Number 14789  ]https://www.caymanchem.com/images/catalog/14789.png Fluoropentyl-JWH-018 indazole; AM2201 indazole analog; 5-fluoro THJ 018 Description AM2201 (Item No. 10707) is a potent synthetic cannabinoid (CB) with Ki values of 1.0 and 2.6 nM for the central CB1 and peripheral CB2 receptors, respectively.1 Structurally, AM2201 is an aminoalkylindole similar to JWH 018 (Item No. 10900). THJ 2201 is an analog of AM2201where indazole replaces the indole group. The physiological and toxicological properties of this compound are not known. This product is intended for forensic and research applications. Synonyms Fluoropentyl-JWH-018 indazole AM2201 indazole analog 5-fluoro THJ 018 Formal Name (1-(5-fluoropentyl)-1H-indazol-3-yl)(naphthalen-1-yl)methanone Molecular Formula C23H21FN2O Formula Weight 360.4 Formulation A crystalline solid Purity ≥98% λmax 219, 320 nm Stability 2 years Storage -20°C Shipping Room temperature in continental US; may vary elsewhere SMILES Copy O=C(C1=CC=CC2=C1C=CC=C2)C3=NN(CCCCCF)C4=C3C=CC=C4 InCHI Code Copy 1S/C23H21FN2O/c24-15-6-1-7-16-26-21-14-5-4-12-20(21)22(25-26)23(27)19-13-8-10-17-9-2-3-11-18(17)19/h2-5,8-14H,1,6-7,15-16H2 InCHI Key Copy DULWRYKFTVFPTL-UHFFFAOYSA-N |
|
|
|
|
|
| hot_assay |
17.03.2014 - 16:02
Сообщение
#280 |
|
|
Цитата(alexlp @ 17.03.2014 - 16:13) THJ 2201 NEW именно это и сбило меня с толку... если THJ-2201 и AM(indazol)-2201 - это одно и то же, то получается, что в библиотеке одно вещество представлено под двумя именами: 915 AM(indazol)-2201-C5-chain-OH-TMS-iso-3$$ 916 AM(indazol)-2201-C5-chain-OH-TMS-iso-2$$ 917 AM(indazol)-2201-C5-chain-OH-TMS-iso1$$ 918 AM(indazol)-2201-C5-chain-OH-TMS-iso-4$$ 922 THJ2201-M5 (-COOH) Me 923 THJ2201-M5 (-COOH) TMS 924 THJ2201-M1 (5-OH) TMS 925 THJ2201-M (-C2-COOH) TMS 926 THJ2201-M (C2-COOH) Me На днях в одном из объектов наряду с уже привычными -COOH метаболитами THJ-2201 были обнаружены упомянутые выше AM(indazol)-2201-C5-chain-OH-TMS-iso-_$$! Структуры и химические названия этих веществ в библиотеке отсутствуют... |
|
|
|
|
|
| Korvet |
17.03.2014 - 16:55
Сообщение
#281 |
|
|
по поводу названий. то что здесь обозначено как THJ, фскн и мвд будут давать как AM(N2)-2201. это индазольный аналог АМ-2201. поэтому я писал АМ(indazol)-2201.
с учетом этим пояснения я думаю стр-ру 915-918 сможете представить сами. Это продукт "вживления" ОН группы в структуру AM(N2)-2201, место "вживления" - алкильная цепь. какой именно атом не известно. 924 - это продукт замещения фтора в молекуле на гидроксил 922-923 - 5- карбокси метаболит то есть CH2-CH2-CH2-CH2-COOH вместо CH2-CH2-CH2-CH2-CH2F исходного 925-926 3- карбокси метаболит то есть -CH2-CH2-COOH вместо CH2-CH2-CH2-CH2-CH2F исходного то есть получается что никаких повторов нет. Но я бы рекомендовал выдавать так как оно будет выдаваться в заключениях полиции. |
|
|
|
|
|
| hot_assay |
17.03.2014 - 17:10
Сообщение
#282 |
|
|
AM(indazol)-2201-C5-chain-OH-TMS-iso-3$$ = THJ-2201-C5-chain-OH-TMS-iso-3$$ ?
Цитата(Korvet @ 17.03.2014 - 17:55) то есть получается что никаких повторов нет. я имел в виду то, что упомянутые вещества, например, 918 AM(indazol)-2201-C5-chain-OH-TMS-iso-4$$ и 922 THJ2201-M5 (-COOH) Me, - это метаболиты одного и того же вещества, обозначенного по-разному. |
|
|
|
|
|
| Korvet |
17.03.2014 - 17:23
Сообщение
#283 |
|
|
как-то трудно знать что Вы имели в виду. в вашем первом вопросе не было никакого
THJ-2201-C5-chain-OH-TMS-iso-3 было вот так: 915 AM(indazol)-2201-C5-chain-OH-TMS-iso-3$$ 916 AM(indazol)-2201-C5-chain-OH-TMS-iso-2$$ 917 AM(indazol)-2201-C5-chain-OH-TMS-iso1$$ 918 AM(indazol)-2201-C5-chain-OH-TMS-iso-4$$ 922 THJ2201-M5 (-COOH) Me 923 THJ2201-M5 (-COOH) TMS 924 THJ2201-M1 (5-OH) TMS 925 THJ2201-M (-C2-COOH) TMS 926 THJ2201-M (C2-COOH) Me AM(indazol)-2201-C5-chain-OH-TMS-iso-4$$ и 922 THJ2201-M5 (-COOH) Me, это метаболиты одного вещества, но с разной стр-рой и обозначенные по разному |
|
|
|
|
|
| hot_assay |
17.03.2014 - 17:37
Сообщение
#284 |
|
|
Ok, большое спасибо за разъяснения!
 |
|
|
|
|
|
| alexlp |
17.03.2014 - 18:28
Сообщение
#285 |
|
|
Цитата(Korvet @ 17.03.2014 - 19:55) Но я бы рекомендовал выдавать так как оно будет выдаваться в заключениях полиции. Я полагаю, что в заключении надо выдавать названия в коннотации списков перечня, а в примечаниях - расшифровывать, приводя наиболее употребимые тривиальные названия, и указывая родительские соединения метаболитов. Это избавит от бессмысленных хождения по судам и взаимопонимание между коллегами и оперативниками. ИМХО. |
|
|
|
|
|
|
| Сейчас: 16.01.2025 - 12:06 |
© 2002-2017 Форум судебных медиков России
Копирование материалов сайта возможно при условии размещения активной ссылки на источник.
Копирование материалов сайта возможно при условии размещения активной ссылки на источник.