Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

Форум судебных медиков России
41 страниц V « < 18 19 20 21 22 > »   
>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
alexlp
сообщение 16.06.2008 - 21:41
Сообщение #1 (закреплено)


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д.
Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip).

Загрузить полный пакет библиотек вы можете как со страницы форума, так и с нового сайта проекта http://sudmed-ms.my1.ru/

SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ

sudmed-ms_2832_amdislib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке.

sudmed-ms_2832_nistlib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь.

SUDMED-MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation)

sudmed-ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary - библиотека в формате Agilent MassHunter

sudmed-ms_2832_lib_20191231.pdf - индексный список содержимого библиотеки

SUDMED-MS_2832_LIB_20191231_new.pdf - сведения об обновлениях

SUDMED_MS_SETUP.pdf - инструкция по установке библиотек SUDMED-MS

Сообщение отредактировал KSS17 - 1.01.2020 - 18:35


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_NNCN_20141108_2.zip ( 14.45 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  4034
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_MS_SETUP.pdf ( 404.04 килобайт ) Кол-во скачиваний:  1000
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231.pdf ( 634.57 килобайт ) Кол-во скачиваний:  807
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_amdislib_20191231.zip ( 1.16 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  625
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip ( 1.11 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  539
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_nistlib_20191231.zip ( 2.61 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  595
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary.zip ( 1.02 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  556
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231_NEW.pdf ( 245.63 килобайт ) Кол-во скачиваний:  837
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231_eng.pdf ( 581.64 килобайт ) Кол-во скачиваний:  848
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
Korvet
сообщение 17.03.2014 - 19:09
Сообщение #286


Магистр форума

Группа: СМЭ
Регистрация: 13.05.2009
Из: Томск
Пользователь №: 14 703


как указано в перечне так далеко не всегда будет, ибо есть такое понятие "производные", вот АМ(N2)-2201, как раз войдет именно как производное, то есть явно в перечне его не будет. так что надо ориентироваться на то как оно будет выдаваться мвд\фскн.

мвд\фскн будут работать либо по АИПСИН, либо по ЕКБДРАГС, и там и там названия будут такие как они сейчас есть в беларусском перечне НСПВ, потому что там вся зараза появляется быстрее чем у нас, там же и формируется АИПСИН.

беларусский перечень доступен здесь

http://mvd.gov.by/ru/main.aspx?guid=151563

вот такой подход мне кажется избавит от недопонимания


Сообщение отредактировал KSS17 - 20.03.2014 - 20:52
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 18.03.2014 - 07:28
Сообщение #287


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Да, именно не понимание специфики имеет место быть. Простой пример из практики работы суд-хим отделения.
Был период, когда нас просто "задолбали" вызовами экспертов в суд по "алкогольным" актам. В подавляющем большинстве случаев вопрос был обескураживающим: "Скажите, этанол - это этиловый спирт?". Ответ: "Да". "Спасибо"....
Стоило в шаблоне заключения изменить фразу "...(не) обнаружен этанол..." на "...(не) обнаружен этиловый спирт..." как вызовы в суды прекратились навсегда. С тех пор стараемся отслеживать все новеллы законодателей и вовремя менять формулировки, например промилле заменять на г/л. Лучше написать лишних 10 букв, чем таскаться по судам. И клава не развалится, если напечатать, что вещество 1 является метаболитом вещества 2, которое является производным наркотического вещества 3, записав последнее в нотации перечня. Тривиальные названия удобны для общения специалистов, юридические - для юристов.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
marko
сообщение 18.03.2014 - 19:28
Сообщение #288


Претендент

Группа: Химики-аналитики
Регистрация: 3.07.2013
Пользователь №: 37 130


Здравствуйте!
Если индазольный вариант называется АМ(N2)2201, то как в ФСКН и МВД называют бензимидазольное производное? На сайте уже было упоминание про BIM2201, а как в действительности.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 18.03.2014 - 19:29
Сообщение #289


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(marko @ 18.03.2014 - 22:28)
Здравствуйте!
Если индазольный вариант называется АМ(N2)2201, то как в ФСКН и МВД называют бензимидазольное производное? На сайте уже было упоминание про BIM2201, а как в действительности.

Криминалисты ФСКН называют его BIM2201. Как его зовут на рынке еще не знаю.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
marko
сообщение 18.03.2014 - 19:43
Сообщение #290


Претендент

Группа: Химики-аналитики
Регистрация: 3.07.2013
Пользователь №: 37 130


Спасибо!
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 26.03.2014 - 10:16
Сообщение #291


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Уважаемые Коллеги!

На скору руку оцифровал спектры метаболитов 3-6 THJ2201 из статьи уважаемого Шевырина с соавторами. Надеюсь авторы не будут возражать против этого?

В архиве, как всегда, спектры в формате библиотеки НИСТсёчь со структурами и библиотечки для АМДИС.

Буду благодарен за замечания и исправления замеченных ошибок.

PS: Оцифровка проведена программой NIST Spectrum Digitizer

Сообщение отредактировал alexlp - 26.03.2014 - 11:05


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SHVR_THJ_004_LIB_20140326.zip ( 52.68 килобайт ) Кол-во скачиваний:  376
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 26.03.2014 - 11:12
Сообщение #292


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(marko @ 18.03.2014 - 22:28)
Здравствуйте!
Если индазольный вариант называется АМ(N2)2201, то как в ФСКН и МВД называют бензимидазольное производное? На сайте уже было упоминание про BIM2201, а как в действительности.

Наши зарубежные коллеги называют его FUBIMINA.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
hot_assay
сообщение 27.03.2014 - 16:19
Сообщение #293


Продвинутый участник

Группа: Участники
Регистрация: 10.07.2008
Из: Ярославль
Пользователь №: 9 065


Цитата(Korvet @ 5.03.2014 - 20:03)
ну я вроде послал свои соображения.

1. предлагаю 5F-AMB называть так как он уже вошел в базы данных криминалистов
индольный собрат будет называтся MMB-2201, индазольный будет MMB(N)-2201.


Подскажите, а в какие именно базы данных криминалистов он вошёл?
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Korvet
сообщение 27.03.2014 - 21:24
Сообщение #294


Магистр форума

Группа: СМЭ
Регистрация: 13.05.2009
Из: Томск
Пользователь №: 14 703


я думаю ЕКБдрагс, если еще будет сущестовать, то туда и точно в АИПСИН.
кстати стр-ра подтверждена на ЯМР, ВЭЖХ-МСВР, в Екатеринбурге
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
hot_assay
сообщение 27.03.2014 - 21:32
Сообщение #295


Продвинутый участник

Группа: Участники
Регистрация: 10.07.2008
Из: Ярославль
Пользователь №: 9 065


Спасибо!
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 30.03.2014 - 11:47
Сообщение #296


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Уважаемые Коллеги!

Сводная библиотека дополнена спектрами метаболитов М3-М6 THJ2201 из статьи уважаемого Шевырина с соавторами:

952 THJ2201-M5-2TMS
953 THJ2201-M6-TMS
954 THJ2201-M3-2TMS
955 THJ2201-M4-TMS

Спектр метилового эфира пентафториндазольной кислоты, ранее обозначенный как 5F-AB-PINACA -M marker, methyl-, переименован в QCBL(N)-2201, в соответствие с последним проектом постановления:

Name: QCBL(N)-2201
Formula: C14H17FN2O2
MW: 264 Exact Mass: 264.127405 ID#: 987 DB: sudmed_956_nistlib_20140329
Contributor: sudmed.ru
Comment: |RI:2153|
Synonyms:
1.methyl 1-(5-fluoropentyl)-1H-indazole-3-carboxylate
2.5F-PB-22(N) -M marker, methyl-
3.5F-AB-PINACA -M marker, methyl-
4.5F-THJ-M marker, methyl-


Буду благодарен за замечания и исправления замеченных ошибок.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 30.03.2014 - 11:58
Сообщение #297


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(alexlp @ 30.03.2014 - 14:47)

Name: QCBL(N)-2201

Буду благодарен за замечания и исправления замеченных ошибок.

Приношу извинения!
Конечно, нужно было написать QCBL(N)-2201 -M marker, methyl- - это досадная ошибка копипаста! Исправлю!
Последняя редакция - SUDMED_956_LIB_20140330

Сообщение отредактировал alexlp - 30.03.2014 - 12:04
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Tatarin_116
сообщение 1.04.2014 - 23:20
Сообщение #298


Участник форума

Группа: Химики-аналитики
Регистрация: 10.01.2011
Пользователь №: 24 928


n,.jn


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  A_pragmatic_approach_to_detect_SPICE_metabolites_in_urine_with_HPLC_MS_MS.pdf ( 437.32 килобайт ) Кол-во скачиваний:  974
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Nayk
сообщение 4.04.2014 - 08:10
Сообщение #299


Опытный участник

Группа: Участники
Регистрация: 24.12.2010
Пользователь №: 24 739


Цитата
Криминалисты ФСКН называют его BIM2201. Как его зовут на рынке еще не знаю.


Name: FUBIMINA
Formula: C23H21FN2O MW: 360 Exact Mass: 360.163792 ID#: 537 DB: rf-des_drug_31.03.2014
Comment: Time()=19.871 min /[not comfirmed] /[DOI:10.1007/s11419-013-0217-2]
10 largest peaks:
271 999 | 359 968 | 360 697 | 127 544 | 272 242 |
243 230 | 258 220 | 331 210 | 257 209 | 244 181 |
Synonyms:
1.(1-(5-fluoropentyl)-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)(naphthalen-1-yl)methanone
2.AM-2201 benzimidazole analog
3.BIM-2201

P.S. Вещество не активно (как и все другие подобной структуры они лиганды СВ-2 рецептора который не отвечает за психоактивность)

Сообщение отредактировал Nayk - 4.04.2014 - 08:16
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Korvet
сообщение 4.04.2014 - 08:19
Сообщение #300


Магистр форума

Группа: СМЭ
Регистрация: 13.05.2009
Из: Томск
Пользователь №: 14 703


Цитата(Nayk @ 4.04.2014 - 09:10)

P.S. Вещество не активно (как и все другие подобной структуры они лиганды СВ-2 рецептора который не отвечает за психоактивность)


а! то-то его нету совсем!значит и не появится. хорошо!
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

41 страниц V « < 18 19 20 21 22 > » 



- Обратная связь Сейчас: 16.01.2025 - 14:11