Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

Форум судебных медиков России
41 страниц V « < 23 24 25 26 27 > »   
>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
alexlp
сообщение 16.06.2008 - 21:41
Сообщение #1 (закреплено)


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д.
Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip).

Загрузить полный пакет библиотек вы можете как со страницы форума, так и с нового сайта проекта http://sudmed-ms.my1.ru/

SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ

sudmed-ms_2832_amdislib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке.

sudmed-ms_2832_nistlib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь.

SUDMED-MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation)

sudmed-ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary - библиотека в формате Agilent MassHunter

sudmed-ms_2832_lib_20191231.pdf - индексный список содержимого библиотеки

SUDMED-MS_2832_LIB_20191231_new.pdf - сведения об обновлениях

SUDMED_MS_SETUP.pdf - инструкция по установке библиотек SUDMED-MS

Сообщение отредактировал KSS17 - 1.01.2020 - 18:35


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_NNCN_20141108_2.zip ( 14.45 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  4034
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_MS_SETUP.pdf ( 404.04 килобайт ) Кол-во скачиваний:  1000
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231.pdf ( 634.57 килобайт ) Кол-во скачиваний:  807
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_amdislib_20191231.zip ( 1.16 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  625
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip ( 1.11 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  539
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_nistlib_20191231.zip ( 2.61 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  595
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary.zip ( 1.02 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  556
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231_NEW.pdf ( 245.63 килобайт ) Кол-во скачиваний:  837
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231_eng.pdf ( 581.64 килобайт ) Кол-во скачиваний:  848
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
alexlp
сообщение 1.10.2014 - 09:16
Сообщение #361


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Не, ну можно канеш, порезать открытые библиотеки, но свято место пусто не останется. На их место придут закрытые, в которые вы уже забесплатно не загляните и не проверите, что там есть и откуда... Это лучше?

ЗЫ: Сразу оговорюсь - я не про АИПСИН и не про EKBDRUGS - эт святое...

Сообщение отредактировал alexlp - 1.10.2014 - 09:38
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Tatarin_116
сообщение 1.10.2014 - 09:37
Сообщение #362


Участник форума

Группа: Химики-аналитики
Регистрация: 10.01.2011
Пользователь №: 24 928


Цитата(alexlp @ 1.10.2014 - 09:16)
Не, ну можно канеш, порезать открытые библиотеки, но свято место пусто не останется. На их место придут закрытые, в которые вы уже забесплатно не загляните и не проверите, что там есть и откуда... Это лучше?

НЕ! NOCH EIN MAL: Речь идет о подтверждении выкладываемых, пусть даже в "отрытые" источники, данных. Вот о чем речь. И если ты их выложил, то отвечаешь за них, а не так как в настоящее время... Вот о чем речь и все вышеприведенные посты об этом. И уж если пошла такая "пьянка", то я предпочитаю заплатить деньги за нормальный программный продукт и не пользоваться (и не пользуемся и у себя в регионе уже несколько лет, и это видно из сообщений даже на этом форуме!) такие "канеш" типа доступные базы "ОБС" и по таким базам, мое, исключительно мое личное мнение, поскольку с уважением отношусь к труду их составителя(ей) проверять что-либо не буду и не проверяю... Смысл в другом. Нужно, чтобы в голове ответственных за данное направление деятельности отложилось: необходимо на экспертном уровне изменение материальной базы соответствующих ведомств (в частности приобретение легитимных программных продуктов). А вот такими действиями как пользование неподтвержденной и т.н. "некоммерческой" базой за которую никто не несет ответственности, на мой взгляд только вредит решению проблемы централизованного обеспечения новейшими технологичными программными продуктами, способными "читать" известные форматы данных, в то время как ваши масс-спектрометры используются только для регистрации данных...
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 1.10.2014 - 09:51
Сообщение #363


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(Tatarin_116 @ 1.10.2014 - 12:37)
... (в частности приобретение легитимных программных продуктов)....

А можно ссылочку для приобретения?
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Tatarin_116
сообщение 1.10.2014 - 10:15
Сообщение #364


Участник форума

Группа: Химики-аналитики
Регистрация: 10.01.2011
Пользователь №: 24 928


Цитата(alexlp @ 1.10.2014 - 09:51)
А можно ссылочку для приобретения?

aipsin.com, хе-хе
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 1.10.2014 - 10:38
Сообщение #365


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(Tatarin_116 @ 1.10.2014 - 13:15)
aipsin.com, хе-хе


Там есть дериваты метаболитов? А МС/МС?
Вообще то АИПСИН и ЕКБДРАГС должны вручатся экспертным подразделениям под подписку вместе с новым постановлением, ИМХО. И это будет необходимой и достаточной гарантией их легитимности. А на сегодня они имеют какую нибудь индульгенцию соответствия от соответствующих Правительств?
Все, о чем Вы говорите - вполне справедливо для экспертных подразделений МВД, УФСКН и т.п.
Но что делать в СХО и ХТЛ? Не подскажите?
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
RedPepper
сообщение 1.10.2014 - 10:45
Сообщение #366


Маэстро форума

Группа: Участники
Регистрация: 29.11.2010
Пользователь №: 24 313


Цитата(alexlp @ 1.10.2014 - 10:38)
А на сегодня они имеют какую нибудь индульгенцию соответствия от соответствующих Правительств?
Не сочтите за рекламу, но на такой вопрос ответить иначе нельзя:

"Официальный статус ИПС «АИПСИН АнтиНаркотики»
1. «АИПСИН» обладает Удостоверением объекта интеллектуальной собственности III-ПП № 2000-04 от 26 сентября 2000 г.
2. «АИПСИН» обладает Свидетельством об официальной регистрации программного продукта «AIPSIN – Электронная информационно-поисковая система комплексного исследования веществ» (Рабочее место эксперта – AIPSIN)
3. ИПС «Аипсин АнтиНаркотики» зарегистрирована в Международном центре по регистрации сериальных изданий ISSN (ЮНЕСКО, г. Париж, Франция) под номером: ISSN 2304-2842
4. ЗАО «БелХард Групп», являясь разработчиком ИПС, обладает Сертификатом соответствия DIN EN ISO 9001:2008, который распространяется, в том числе, и на ИПС «Аипсин Антинаркотики»
5. ЗАО «БелХард Групп», являясь разработчиком ИПС, обладает Сертификатом соответствия СТБ ISO 9001-2009, который распространяется, в том числе, и на ИПС «Аипсин Антинаркотики»
6. ИПС «Аипсин АнтиНаркотики» зарегистрирована в государственном реестре информационных ресурсов Республики Беларусь под № 1311203273 от 26 ноября 2012 года
7. ЗАО «БелХард Групп», являясь разработчиком ИПС, является обладателем Дипломом и бронзовой медалью VI Московского международного салона инноваций и инвестиций в 2006 г. за разработку модульной структуры программного обеспечения AIPSIN в европейской версии
8. В Республике Беларусь ИПС «АИПСИН АнтиНаркотики» является частью Государственной программы по борьбе с преступностью, утверждённой Указом Президента РБ №103 от 21.02.2006 г. (п.33.1), и внедрена в подразделениях МВД, Прокуратуры, Верховного суда, Высшего Хозяйственного суда, КГБ, ГТК, Госкомпогранвойск, Минюста, МЧС, ГСМСЭ.
9. Решением научно-практической секции ЭКЦ МВД по Омской области РФ от 17.03.2009 года опыт работы по применению ИПС «АИПСИН АнтиНаркотики» в экспертной практике признан положительным и рекомендован для внедрения в оперативно-служебную деятельность.
10. ИПС обладает свыше 20 положительных отзывов и рекомендаций к использованию от правоохранительных органов Республики Беларусь (МВД, ГТК), Российской Федерации (ФСКН, ФСБ, ФТС, МВД), а также исполнительных органов СНГ и Евросоюза."
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Tatarin_116
сообщение 1.10.2014 - 11:03
Сообщение #367


Участник форума

Группа: Химики-аналитики
Регистрация: 10.01.2011
Пользователь №: 24 928


"Там есть дериваты метаболитов? А МС/МС?
Вообще то АИПСИН и ЕКБДРАГС должны вручатся экспертным подразделениям под подписку вместе с новым постановлением"

Ну-ну, ждите когда что-то кому-то вручат (или вручат: "Седло большое, ковер и телевизор"). Насколько мне известно и в плане наработок по метаболитам АИПСИН продвигается... Ну, а разве в том же самом NIST'е (возьми период с 98 по нынешний год) так уже много метаболомики? Ну героин, возможно, ну фитоканнабиноиды (изученыее-переизученные в 60-х годах), а что Вы хотите по новым психоактивам? "Пфлегер-Мауер Токс" - отстал неимоверно, даже от того, что обсуждается здесь. Ведь даже выше уже писал, да и Вы сами успешно моделируете по полученным Вами масс-спектрам для близких структур предпочтительные метаболиты... Ну если МС/МС Вы лично сами получаете, то какие проблемы для дериватов метаболитов? Чет не серьезные какие-то вопросы...

Сообщение отредактировал Tatarin_116 - 1.10.2014 - 11:10
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Korvet
сообщение 1.10.2014 - 16:06
Сообщение #368


Магистр форума

Группа: СМЭ
Регистрация: 13.05.2009
Из: Томск
Пользователь №: 14 703


неее сооорьтэсь горяччие эстоонские пааарни!

хоть легальна база хоть, нет, все дело в конечном исполнителе, в сети полно валяется сканов заключений, где товарищи ссылаясь на нист, екб и пр. пишут откровенную лажу....из той же оперы и тот момент что кто-то просто не понимает для чего нужны библиотеки, что такое сходство, подтверждение и т.п. конечно Nayk может сколько угодно говорить что его БД это для ориентировки, это ни сколько не убавит кол-во людей ссылающихся на нее в своих заключениях, или не ссылающихся ни на что в принципе, но пользующихся этой инфой. Все новинки там по умолчанию "предположительно", но кто бы об этом задумывался, когда люди слово presumable написанное черным по белому не видят...не уверен что средний МВД-ФСКН эксперт вообще заглянул в словарь по поводу этого термина и знает его смысл!, это к вопросу о тегах...или каких-то там еще кегах...
да и вообще у нас рейтинг доверия к тому что с экрана достаточно высок без включения мозгов, кажется процентов 82-83....вот то же самое кол-во пользующихся скачанными базам будет без зазрения совести писать заключения....

Вообще я бы на месте Nayk, добавил сквалан или циклотриметилсилоксан, как какой-нить новый супер наркотик....вот бы шумиха-то поднялась....флеш-моб федерального масштаба, да и пермь заключения бы дала...может это бы чему-то научило людей...
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 1.10.2014 - 16:20
Сообщение #369


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(RedPepper @ 1.10.2014 - 13:45)
Не сочтите за рекламу, но на такой вопрос ответить иначе нельзя:

"Официальный статус ИПС «АИПСИН АнтиНаркотики»
1. «АИПСИН» обладает Удостоверением объекта интеллектуальной собственности III-ПП № 2000-04 от 26 сентября 2000 г.
2. «АИПСИН» обладает Свидетельством об официальной регистрации программного продукта «AIPSIN – Электронная информационно-поисковая система комплексного исследования веществ» (Рабочее место эксперта – AIPSIN)
3. ИПС «Аипсин АнтиНаркотики» зарегистрирована в Международном центре по регистрации сериальных изданий ISSN (ЮНЕСКО, г. Париж, Франция) под номером: ISSN 2304-2842
4. ЗАО «БелХард Групп», являясь разработчиком ИПС, обладает Сертификатом соответствия DIN EN ISO 9001:2008, который распространяется, в том числе, и на ИПС «Аипсин Антинаркотики»
5. ЗАО «БелХард Групп», являясь разработчиком ИПС, обладает Сертификатом соответствия СТБ ISO 9001-2009, который распространяется, в том числе, и на ИПС «Аипсин Антинаркотики»
6. ИПС «Аипсин АнтиНаркотики» зарегистрирована в государственном реестре информационных ресурсов Республики Беларусь под № 1311203273 от 26 ноября 2012 года
7. ЗАО «БелХард Групп», являясь разработчиком ИПС, является обладателем Дипломом и бронзовой медалью VI Московского международного салона инноваций и инвестиций в 2006 г. за разработку модульной структуры программного обеспечения AIPSIN в европейской версии
8. В Республике Беларусь ИПС «АИПСИН АнтиНаркотики» является частью Государственной программы по борьбе с преступностью, утверждённой Указом Президента РБ №103 от 21.02.2006 г. (п.33.1), и внедрена в подразделениях МВД, Прокуратуры, Верховного суда, Высшего Хозяйственного суда, КГБ, ГТК, Госкомпогранвойск, Минюста, МЧС, ГСМСЭ.
9. Решением научно-практической секции ЭКЦ МВД по Омской области РФ от 17.03.2009 года опыт работы по применению ИПС «АИПСИН АнтиНаркотики» в экспертной практике признан положительным и рекомендован для внедрения в оперативно-служебную деятельность.
10. ИПС обладает свыше 20 положительных отзывов и рекомендаций к использованию от правоохранительных органов Республики Беларусь (МВД, ГТК), Российской Федерации (ФСКН, ФСБ, ФТС, МВД), а также исполнительных органов СНГ и Евросоюза."

СУПЕР! Жду с нетерпением появления этого продукта на своем рабочем месте (уже где-то на подходе), НО: Той самой индульгенции/сертификата/аккредитации от Правительства, что мол то, что в наших списках - это то, что в этой Базе - НЕТУ! Или я не увидел?
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Tatarin_116
сообщение 1.10.2014 - 16:45
Сообщение #370


Участник форума

Группа: Химики-аналитики
Регистрация: 10.01.2011
Пользователь №: 24 928


Дорогой Korvet! Лично я не ссорюсь и не собираюсь этого делать, лишь высказал свою точку зрения. К тому, чем занимается Nayk, к его знаниям и трудолюбию, к сбору им информации по новым психоактивам, к тому, что это его личная база некий ориентир (опять же в рамках какой структуры?) отношусь с уважением. Другое дело, то о чем ты пишешь в своем посте (ту?)
Если Вы, уважаемый alexlp "юзали" последний вариант масс-спектрального идентификатора базы АИПСИН-антинаркотики, то наверное у Вас бы этих вопросов не возникало, к сожалению не могу здесь рассказать и показать всю эту интереснейшую конструкцию, привязанную к национальным и международным Спискам контролируемых веществ... По моему это было в прошлогоднем, либо в одном из первых Пресс-релизов АИПСИНА... Предлагаю Вам ознакомится с ними на официальном сайте АИПСИНА..., а когда кол-во исследований в Вашем регионе новых психоактивов захлестнет за 70-80 %, поверьте, никакие Ваши базы, ориентировочные и не ориентировочные не спасут ситуацию... А что если Nayk, к примеру, либо кто-то еще, на ком все это держится уйдет, например, на пенсию и забъет на все большой "болт" Где уж тогда брать станете эти данные, ведь реально кто чем-то занимается всерьез можно пересчитать по пальцам одной руки wacko.gif это

Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
RedPepper
сообщение 1.10.2014 - 16:47
Сообщение #371


Маэстро форума

Группа: Участники
Регистрация: 29.11.2010
Пользователь №: 24 313


Цитата(alexlp @ 1.10.2014 - 16:20)
Той самой индульгенции/сертификата/аккредитации от Правительства, что мол то, что в наших списках - это то, что в этой Базе - НЕТУ! Или я не увидел?
Честно говоря, не совсем понял, о чём вы... Это, в смысле, если в этой базе вещества нету, значит оно неподконтрольно и наоборот?

Хотя... что бы вы не имели в виду, лично для меня и моих коллег представленного выше набора документов абсолютно достаточно - я даже и не знаю, что ещё можно требовать от разработчиков.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Гермиона
сообщение 3.10.2014 - 16:53
Сообщение #372


Авторитетный участник

Группа: Химики-аналитики
Регистрация: 20.01.2011
Пользователь №: 25 109


Цитата(Tatarin_116 @ 1.10.2014 - 12:37)
И уж если пошла такая "пьянка", то я предпочитаю заплатить деньги за нормальный программный продукт...

Доброго времени суток!
Мы тоже предпочитаем пользоваться нормальными программными продуктами, приобретенными как положено. Да только вот беда: пока при существующем законодательстве в области закупок такой продукт приобретется (если еще удастся приобрести именно то, что нужно, а не то, что смутно похоже на прописанное в техзадании) - это все-равно будет продукт уже позавчерашнего дня. И после всех необходимых согласований и сертификаций будет иметь, увы, уже историческое значение для идентификации синтетических наркотиков сегодняшнего времени.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Tatarin_116
сообщение 3.10.2014 - 17:46
Сообщение #373


Участник форума

Группа: Химики-аналитики
Регистрация: 10.01.2011
Пользователь №: 24 928


Цитата(Гермиона @ 3.10.2014 - 16:53)
Доброго времени суток!
Мы тоже предпочитаем пользоваться нормальными программными продуктами, приобретенными как положено. Да только вот беда: пока при существующем законодательстве в области закупок такой продукт приобретется (если еще удастся приобрести именно то, что нужно, а не то, что смутно похоже на прописанное в техзадании) - это все-равно будет продукт уже позавчерашнего дня. И после всех необходимых согласований и сертификаций будет иметь, увы, уже историческое значение для идентификации синтетических наркотиков сегодняшнего времени.

Уважаемая Гермиона!Если Вы вообще в курсе масс-спектральная База данных АИПСИН обновляется ежеквартально. Зайдите на сайт АИПСИНА и почитайте внимательно информацию о данном продукте. Наверное тогда не буду возникать Ваши опасения по-поводу исторического значения, в частности данного продукта, как впрочем, если обновлять ежегодного БД "Designer Drugs" P. Rosner'a, которая в подметки не годится по оперативности представляемого материала и обновляемости АИПСИНу. Поверьте, но это так...
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Гермиона
сообщение 3.10.2014 - 19:44
Сообщение #374


Авторитетный участник

Группа: Химики-аналитики
Регистрация: 20.01.2011
Пользователь №: 25 109


Цитата(Tatarin_116 @ 3.10.2014 - 20:46)
Уважаемая Гермиона!Если Вы вообще в курсе масс-спектральная База данных АИПСИН обновляется ежеквартально. Зайдите на сайт АИПСИНА и почитайте внимательно информацию о данном продукте. Наверное тогда не буду возникать Ваши опасения по-поводу исторического значения, в частности данного продукта, как впрочем, если обновлять ежегодного БД "Designer Drugs" P. Rosner'a, которая в подметки не годится по оперативности представляемого материала и обновляемости АИПСИНу. Поверьте, но это так...


Уважаемый Tatarin_116!
Вы наверно удивитесь, но Вы не единственный, кто знает об этой базе данных, равно как и о других. Только в базы данных, успешно применяемых в ЭКЦ, к великому сожалению, не включены масс-спектры продуктов метаболизма этих соединений в организме человека. Это при том, что часто доказательством факта употребления психоактивного вещества является выявление одного из его метаболитов (маркеров употребления) в биологических жидкостях. А самого вещества в нативном виде в биологическом материале может и не быть - по той простой причине, что попадая в организм человека (или животных) вещества имеют обыкновение подвергаться превращениям.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Tatarin_116
сообщение 3.10.2014 - 19:56
Сообщение #375


Участник форума

Группа: Химики-аналитики
Регистрация: 10.01.2011
Пользователь №: 24 928


Цитата(Гермиона @ 3.10.2014 - 19:44)
Уважаемый Tatarin_116!
Вы наверно удивитесь, но Вы не единственный, кто знает об этой базе данных, равно как и о других. Только в базы данных, успешно применяемых в ЭКЦ, к великому сожалению, не включены масс-спектры продуктов метаболизма этих соединений в организме человека. Это при том, что часто доказательством факта употребления психоактивного вещества является выявление одного из его метаболитов (маркеров употребления) в биологических жидкостях. А самого вещества в нативном виде в биологическом материале может и не быть - по той простой причине, что попадая в организм человека (или животных) вещества имеют обыкновение подвергаться превращениям.


Мы (мои коллеги и я ) ее не просто знаем, а активно ею пользуемся. Ну уж и понятно где нам, простым ментам, знать, что нативное вещество в организме метаболирует... Еще раз повторюсь (см. посты выше) классов активно применяемых психоактивов не так уж много, аналогии по продуктам метаболизма напрашиваются сами собой, и грамотному химику-аналитику правильно интерпретируя масс-спектральную информацию ничего не стоит решить задачку, которая под силу студенту 3-го курса химического факультета университета в рамках спецкурса "Строение вещества"... Уже давно ничему не удивляюсь cool.gif

Сообщение отредактировал Tatarin_116 - 3.10.2014 - 19:57
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

41 страниц V « < 23 24 25 26 27 > » 



- Обратная связь Сейчас: 16.01.2025 - 10:54