Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

Форум судебных медиков России
41 страниц V « < 2 3 4 5 6 > »   
>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
alexlp
сообщение 16.06.2008 - 21:41
Сообщение #1 (закреплено)


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д.
Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip).

Загрузить полный пакет библиотек вы можете как со страницы форума, так и с нового сайта проекта http://sudmed-ms.my1.ru/

SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ

sudmed-ms_2832_amdislib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке.

sudmed-ms_2832_nistlib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь.

SUDMED-MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation)

sudmed-ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary - библиотека в формате Agilent MassHunter

sudmed-ms_2832_lib_20191231.pdf - индексный список содержимого библиотеки

SUDMED-MS_2832_LIB_20191231_new.pdf - сведения об обновлениях

SUDMED_MS_SETUP.pdf - инструкция по установке библиотек SUDMED-MS

Сообщение отредактировал KSS17 - 1.01.2020 - 18:35


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_NNCN_20141108_2.zip ( 14.45 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  4036
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_MS_SETUP.pdf ( 404.04 килобайт ) Кол-во скачиваний:  1003
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231.pdf ( 634.57 килобайт ) Кол-во скачиваний:  816
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_amdislib_20191231.zip ( 1.16 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  625
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip ( 1.11 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  540
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_nistlib_20191231.zip ( 2.61 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  595
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary.zip ( 1.02 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  558
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231_NEW.pdf ( 245.63 килобайт ) Кол-во скачиваний:  840
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231_eng.pdf ( 581.64 килобайт ) Кол-во скачиваний:  852
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
trozen
сообщение 23.12.2010 - 23:34
Сообщение #46


Читатель

Группа: Участники
Регистрация: 15.04.2009
Пользователь №: 14 104


Цитата(KNIISE @ 23.12.2010 - 16:15)
Всех приветствую!
Прошу совета и рекомендаций, какой реагентный газ выбрать - метан или изобутан?


изобутан будет еще давать М+43 и М+57. не со всеми соединениями, но частенько.
это тоже помогает..
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Nayk
сообщение 24.12.2010 - 12:51
Сообщение #47


Опытный участник

Группа: Участники
Регистрация: 24.12.2010
Пользователь №: 24 739


Наша небольшая база


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  UFSKN_CHUV_23.12.2010.zip ( 37.85 килобайт ) Кол-во скачиваний:  613
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Korvet
сообщение 29.12.2010 - 19:22
Сообщение #48


Магистр форума

Группа: СМЭ
Регистрация: 13.05.2009
Из: Томск
Пользователь №: 14 703


Программка для конвертирования табличных и графических данных масс-спектров в формат библиотеки Agilent Chemstation. Особенно будет полезно тому у кого нету Nist search.
в архиве инструкция о том как это работает и небольшая библиотечка сформированная мной с её помощью. также прилагаю лит. данные из которых взяты масс-спектры.


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  ____________.rar ( 1.1 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  728
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KSS17
сообщение 29.12.2010 - 20:39
Сообщение #49


Мастер I
Group Icon
Группа: Модераторы
Регистрация: 15.08.2007
Пользователь №: 5 557


Здравствуйте!
Цитата(Korvet @ 29.12.2010 - 21:22)
Программка для конвертирования табличных и графических данных масс-спектров в формат библиотеки Agilent Chemstation. ...

Спасибо огромное! rotate.gif
Замаялся вести по две библиотеки...
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Korvet
сообщение 29.12.2010 - 21:28
Сообщение #50


Магистр форума

Группа: СМЭ
Регистрация: 13.05.2009
Из: Томск
Пользователь №: 14 703


Если Вы серьезно, то пользуйтесь на здоровье, конечно. Только что-то я не пойму как это позволит не вести 2 библиотеки...Если у Вас есть Nist search, то Вам эта штука не очень и нужна, разве только рисунковые масс-спектры удобнее в библиотеку загонять...

Надо ещё учитывать что agilent использует PBM алгоритм при библиотечном поиске, в то время как при малом числе пиков конечно предпочтительнее сортировка по R.Math., этот алгоритм реализован в Nist. Однако при числе пиков 8-9 и PBM дает вполне адекватные р-ты.

В любом случае если кого-то заинтересует данная разработка, просьба отписаться на почту 6901-соб-rambler.ru, буду высылать обновления.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KNIISE
сообщение 30.12.2010 - 16:41
Сообщение #51


Продвинутый участник

Группа: Участники
Регистрация: 16.03.2010
Пользователь №: 20 614


Цитата(Nayk @ 24.12.2010 - 11:51)
Наша небольшая база


В каком формате?

Он-лайн библиотека УФ ИК ЯМР спектров фармпрепаратов и субстанций: _http://www.pharmbook.com.ua/uvirnmr/start
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KNIISE
сообщение 6.01.2011 - 18:33
Сообщение #52


Продвинутый участник

Группа: Участники
Регистрация: 16.03.2010
Пользователь №: 20 614


Налетай, шевелись - разбирай живопись!
Рождественский подарок - последние версии АМДИСА и МС-смотрелки + база 08:


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  ________.txt ( 2.55 килобайт ) Кол-во скачиваний:  1443
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
A58
сообщение 7.01.2011 - 14:16
Сообщение #53


Продвинутый участник

Группа: СМЭ
Регистрация: 4.02.2010
Из: Урал-Батюшка
Пользователь №: 19 783


Цитата(KNIISE @ 6.01.2011 - 18:33)
Налетай, шевелись - разбирай живопись!
Рождественский подарок - последние версии АМДИСА и МС-смотрелки + база 08:

Спасибо за "Живопись"!

Сообщение отредактировал KSS17 - 7.01.2011 - 17:04
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
xumuk
сообщение 22.01.2011 - 14:00
Сообщение #54


Новичок

Группа: Участники
Регистрация: 13.11.2010
Пользователь №: 24 030


Видел в интернете письмо ФСКН, в котором записаны производные. Любопытная фраза была написана в конце: "Информация о масс-спектрах указанных веществ, а также других вновь
появляющихся производных, будет размещаться на FTP сервере."
Очень бы хотелось оперативно получать масс-спектры с этого сервера. Может быть кто в курсе?


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  proizvodnie.pdf ( 156.56 килобайт ) Кол-во скачиваний:  2384
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
brainless
сообщение 23.01.2011 - 01:07
Сообщение #55


Опытный участник

Группа: Участники
Регистрация: 6.08.2009
Пользователь №: 16 087


В курсе. Ничего нового там с тех пор не появилось.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Korvet
сообщение 23.01.2011 - 14:18
Сообщение #56


Магистр форума

Группа: СМЭ
Регистрация: 13.05.2009
Из: Томск
Пользователь №: 14 703


Спектры полученные из лит. данных. кому надо могут выложить ссылки там 14 мегов pdf-ок.


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  ____________.rar ( 80.67 килобайт ) Кол-во скачиваний:  623
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
brainless
сообщение 23.01.2011 - 15:41
Сообщение #57


Опытный участник

Группа: Участники
Регистрация: 6.08.2009
Пользователь №: 16 087


Цитата(Korvet @ 23.01.2011 - 14:18)
кому надо могут выложить ссылки там 14 мегов pdf-ок.

Да, сами источники тоже нужны.
Дайте ссылки пожалуйста.

За библиотеку - спасибо.

Сообщение отредактировал brainless - 23.01.2011 - 15:42
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Korvet
сообщение 23.01.2011 - 17:19
Сообщение #58


Магистр форума

Группа: СМЭ
Регистрация: 13.05.2009
Из: Томск
Пользователь №: 14 703


не-а не могу присоединить, 14 мегов не прикрепляется чиркните пустое письмо на 6901-rambler я вам вышлю файлы, или сообщите приемлемый для вас файлообменник.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
RedPepper
сообщение 25.01.2011 - 18:40
Сообщение #59


Маэстро форума

Группа: Участники
Регистрация: 29.11.2010
Пользователь №: 24 313


Коллеги, выкладываю библиотеку (NIST-формат), подготовленную совместно с Korvet'ом (RedPepper&Korvet Production smile.gif , так сказать) по материалам одной из последних статей по "дизайнам", а именно "Analysis of NRG ‘legal highs’ in the UK: Identification and formation of novel cathinones", Drug Test. Analysis (2010), S. D. Brandt et al.
Библиотека содержит масс-спектры 5-ти веществ: Pentylone, MDPBP, MPPP, MDPV и 4-FMC. Есть один ньюанс: спектры сняты с использованием ионной ловушки (ion trap, EI-IT-MS), поэтому немного могут отличаться по интенсивностям регистрируемых ионов от наших квадрупольных спектров. Math-фактор в NIST этих спектров с нашими составляет примерно 850-900.

Благодарим автора статьи (Simon D. Brandt), который ответил на письмо Korvet'a и предоставил интересующую всех нас информацию.

P.S.: если у кого-то уже есть реальный спектр Pentylon'a, просьба поделиться. По поводу текста статьи - обращайтесь напрямую к Korvet


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  RPK_IT.05.rar ( 31.13 килобайт ) Кол-во скачиваний:  545
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
RedPepper
сообщение 25.01.2011 - 23:05
Сообщение #60


Маэстро форума

Группа: Участники
Регистрация: 29.11.2010
Пользователь №: 24 313


Думаю, весьма полезная ссылка:
http://forendex.southernforensic.org...php/home/index

Есть ИК- и масс-спектры...
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

41 страниц V « < 2 3 4 5 6 > » 



- Обратная связь Сейчас: 28.01.2025 - 19:40