Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )
Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных |
alexlp |
16.06.2008 - 21:41
Сообщение
#1 (закреплено) |
Мастер II Группа: СМЭ Регистрация: 14.06.2008 Пользователь №: 8 835 |
Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д. Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip). Загрузить полный пакет библиотек вы можете как со страницы форума, так и с нового сайта проекта SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ sudmed-ms_2832_amdislib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке. sudmed-ms_2832_nistlib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь. SUDMED-MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation) sudmed-ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary - библиотека в формате Agilent MassHunter sudmed-ms_2832_lib_20191231.pdf - индексный список содержимого библиотеки SUDMED-MS_2832_LIB_20191231_new.pdf - сведения об обновлениях SUDMED_MS_SETUP.pdf - инструкция по установке библиотек SUDMED-MS Прикрепленные файлы SUDMED_NNCN_20141108_2.zip ( 14.45 мегабайт ) Кол-во скачиваний: 4036 SUDMED_MS_SETUP.pdf ( 404.04 килобайт ) Кол-во скачиваний: 1003 sudmed_ms_2832_lib_20191231.pdf ( 634.57 килобайт ) Кол-во скачиваний: 816 sudmed_ms_2832_amdislib_20191231.zip ( 1.16 мегабайт ) Кол-во скачиваний: 625 SUDMED_MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip ( 1.11 мегабайт ) Кол-во скачиваний: 540 sudmed_ms_2832_nistlib_20191231.zip ( 2.61 мегабайт ) Кол-во скачиваний: 595 sudmed_ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary.zip ( 1.02 мегабайт ) Кол-во скачиваний: 558 sudmed_ms_2832_lib_20191231_NEW.pdf ( 245.63 килобайт ) Кол-во скачиваний: 840 sudmed_ms_2832_lib_20191231_eng.pdf ( 581.64 килобайт ) Кол-во скачиваний: 852 |
Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных |
trozen |
23.12.2010 - 23:34
Сообщение
#46 |
Читатель Группа: Участники Регистрация: 15.04.2009 Пользователь №: 14 104 |
|
Nayk |
24.12.2010 - 12:51
Сообщение
#47 |
Опытный участник Группа: Участники Регистрация: 24.12.2010 Пользователь №: 24 739 |
Наша небольшая база
Прикрепленные файлы UFSKN_CHUV_23.12.2010.zip ( 37.85 килобайт ) Кол-во скачиваний: 613 |
Korvet |
29.12.2010 - 19:22
Сообщение
#48 |
Магистр форума Группа: СМЭ Регистрация: 13.05.2009 Из: Томск Пользователь №: 14 703 |
Программка для конвертирования табличных и графических данных масс-спектров в формат библиотеки Agilent Chemstation. Особенно будет полезно тому у кого нету Nist search.
в архиве инструкция о том как это работает и небольшая библиотечка сформированная мной с её помощью. также прилагаю лит. данные из которых взяты масс-спектры. Прикрепленные файлы ____________.rar ( 1.1 мегабайт ) Кол-во скачиваний: 728 |
KSS17 |
29.12.2010 - 20:39
Сообщение
#49 |
Мастер I Группа: Модераторы Регистрация: 15.08.2007 Пользователь №: 5 557 |
|
Korvet |
29.12.2010 - 21:28
Сообщение
#50 |
Магистр форума Группа: СМЭ Регистрация: 13.05.2009 Из: Томск Пользователь №: 14 703 |
Если Вы серьезно, то пользуйтесь на здоровье, конечно. Только что-то я не пойму как это позволит не вести 2 библиотеки...Если у Вас есть Nist search, то Вам эта штука не очень и нужна, разве только рисунковые масс-спектры удобнее в библиотеку загонять...
Надо ещё учитывать что agilent использует PBM алгоритм при библиотечном поиске, в то время как при малом числе пиков конечно предпочтительнее сортировка по R.Math., этот алгоритм реализован в Nist. Однако при числе пиков 8-9 и PBM дает вполне адекватные р-ты. В любом случае если кого-то заинтересует данная разработка, просьба отписаться на почту 6901-соб-rambler.ru, буду высылать обновления. |
KNIISE |
30.12.2010 - 16:41
Сообщение
#51 |
Продвинутый участник Группа: Участники Регистрация: 16.03.2010 Пользователь №: 20 614 |
|
KNIISE |
6.01.2011 - 18:33
Сообщение
#52 |
Продвинутый участник Группа: Участники Регистрация: 16.03.2010 Пользователь №: 20 614 |
Налетай, шевелись - разбирай живопись!
Рождественский подарок - последние версии АМДИСА и МС-смотрелки + база 08: Прикрепленные файлы ________.txt ( 2.55 килобайт ) Кол-во скачиваний: 1443 |
A58 |
7.01.2011 - 14:16
Сообщение
#53 |
Продвинутый участник Группа: СМЭ Регистрация: 4.02.2010 Из: Урал-Батюшка Пользователь №: 19 783 |
|
xumuk |
22.01.2011 - 14:00
Сообщение
#54 |
Новичок Группа: Участники Регистрация: 13.11.2010 Пользователь №: 24 030 |
Видел в интернете письмо ФСКН, в котором записаны производные. Любопытная фраза была написана в конце: "Информация о масс-спектрах указанных веществ, а также других вновь
появляющихся производных, будет размещаться на FTP сервере." Очень бы хотелось оперативно получать масс-спектры с этого сервера. Может быть кто в курсе? Прикрепленные файлы proizvodnie.pdf ( 156.56 килобайт ) Кол-во скачиваний: 2384 |
brainless |
23.01.2011 - 01:07
Сообщение
#55 |
Опытный участник Группа: Участники Регистрация: 6.08.2009 Пользователь №: 16 087 |
В курсе. Ничего нового там с тех пор не появилось.
|
Korvet |
23.01.2011 - 14:18
Сообщение
#56 |
Магистр форума Группа: СМЭ Регистрация: 13.05.2009 Из: Томск Пользователь №: 14 703 |
Спектры полученные из лит. данных. кому надо могут выложить ссылки там 14 мегов pdf-ок.
Прикрепленные файлы ____________.rar ( 80.67 килобайт ) Кол-во скачиваний: 623 |
brainless |
23.01.2011 - 15:41
Сообщение
#57 |
Опытный участник Группа: Участники Регистрация: 6.08.2009 Пользователь №: 16 087 |
|
Korvet |
23.01.2011 - 17:19
Сообщение
#58 |
Магистр форума Группа: СМЭ Регистрация: 13.05.2009 Из: Томск Пользователь №: 14 703 |
не-а не могу присоединить, 14 мегов не прикрепляется чиркните пустое письмо на 6901-rambler я вам вышлю файлы, или сообщите приемлемый для вас файлообменник.
|
RedPepper |
25.01.2011 - 18:40
Сообщение
#59 |
Маэстро форума Группа: Участники Регистрация: 29.11.2010 Пользователь №: 24 313 |
Коллеги, выкладываю библиотеку (NIST-формат), подготовленную совместно с Korvet'ом (RedPepper&Korvet Production , так сказать) по материалам одной из последних статей по "дизайнам", а именно "Analysis of NRG ‘legal highs’ in the UK: Identification and formation of novel cathinones", Drug Test. Analysis (2010), S. D. Brandt et al.
Библиотека содержит масс-спектры 5-ти веществ: Pentylone, MDPBP, MPPP, MDPV и 4-FMC. Есть один ньюанс: спектры сняты с использованием ионной ловушки (ion trap, EI-IT-MS), поэтому немного могут отличаться по интенсивностям регистрируемых ионов от наших квадрупольных спектров. Math-фактор в NIST этих спектров с нашими составляет примерно 850-900. Благодарим автора статьи (Simon D. Brandt), который ответил на письмо Korvet'a и предоставил интересующую всех нас информацию. P.S.: если у кого-то уже есть реальный спектр Pentylon'a, просьба поделиться. По поводу текста статьи - обращайтесь напрямую к Korvet'у Прикрепленные файлы RPK_IT.05.rar ( 31.13 килобайт ) Кол-во скачиваний: 545 |
RedPepper |
25.01.2011 - 23:05
Сообщение
#60 |
Маэстро форума Группа: Участники Регистрация: 29.11.2010 Пользователь №: 24 313 |
Думаю, весьма полезная ссылка:
Есть ИК- и масс-спектры... |
Сейчас: 28.01.2025 - 19:40 |