[alexlp]

Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д.
Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip).

Загрузить полный пакет библиотек вы можете как со страницы форума, так и с нового сайта проекта http://sudmed-ms.my1.ru/

SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ

sudmed-ms_2832_amdislib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке.

sudmed-ms_2832_nistlib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь.

SUDMED-MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation)

sudmed-ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary - библиотека в формате Agilent MassHunter

sudmed-ms_2832_lib_20191231.pdf - индексный список содержимого библиотеки

SUDMED-MS_2832_LIB_20191231_new.pdf - сведения об обновлениях

SUDMED_MS_SETUP.pdf - инструкция по установке библиотек SUDMED-MS

Сообщение отредактировал KSS17 - 1.01.2020 - 18:35

[alexlp]

Уважаемые Коллеги!

Вышло очередное обновление АИПСИН:

...В данное обновление включено новое приложение Масс-спектральный идентификтор, которое может использоваться для анализа спектров в формате msp,
сохраненных в сторонних программах, например, amdis. В последующих версиях мы планируем добавить возможность прямого вызова
Масс-спектрального идентификатора из таких программ как amdis и chemstation.

С подробным списком изменений баз данных АИПСИН (в том числе со списком новых масс-спектров)
вы можете ознакомиться на нашем сайте http://aipsin.com в разделе обновлений.

Уважаемые белорусские коллеги двигаются в правильном направлении!

[alexlp]

Уважаемые Коллеги!

Вышло очередное обновление АИПСИН:
Уважаемые белорусские коллеги двигаются в правильном направлении!

Пара слов о том, как из АМДИС переместить спектр для идентификации в АИПСИН:
1. Провести деконволюцию и идентификацию в АМДИС
2. Перегнать спектр интересующего компонента в НИСТсёч
3. Экспортировать из НИСТсёч спектр компонента в формате MSP
4. Открыть этот спектр в АИПСИН.

Да, длинная цепочка, но оно того стоит.

[alexlp]

Уважаемые Коллеги!

Во первых - от всей души поздравляю женскую половину с 8 марта!!!
Желаю всем Цветов, Улыбок, Любви!

Приношу извинения за задержку с обновлением, но, поверьте, были веские причины.
Обновления и изменения состоят из 4 частей (полный список из 140 позиций тут ):

1. Пересмотрены спектры на предмет их подтвержденности:
С части спектров снят тег [not confirmed].
В не подтвержденных спектрах тег [not confirmed] перенесен в основное название для того, чтобы акцентировать на этом внимание исследователя/эксперта.

2. Большое добавление из библиотеки rf-des_drug_04.03.2015 (от уважаемого Nayk):
1 25B-NBOMe TFA derivative
2 PhA-CHM ### [not confirmed]
3 PhA-2201 ### [not confirmed]
4 PhA-022 ### [not confirmed]
5 PhA-018
6 JWH-CHM ### [not confirmed]
7 1-(1-(cyclohexylmethyl)-1H-indol-3-yl)ethanone ### [not confirmed]
8 CBL(N)-018
9 Brephedrone
10 Brephedrone, -TFA
11 4-FMA
12 4-FMA, -TFA
13 2C-I-NBOMe
14 2C-I-NBOMe, -TFA
15 Levamisole
16 Galantamin
17 Cocaine
18 Galantamin, -TMS
19 MBA-CHM
20 Butylone degradant
21 Super degradant α-PVP ### [not confirmed]
22 JWH-192 ### [not confirmed]

3. Оригинальные спектры от уважаемых A58, A.Snyatkov, Marko, Alexlp разной степени конфирмности:
1 FAB144 M28 (-COOH) degradant TMS ### [NOT CONFIRMED]
2 MDMB(N)-Bz-F Marker-2, Me ### ADB-FUBINACA Marker-2, Me ### [NOT CONFIRMED]
3 4F-α-PVP oxo= methabolite
4 Tropicamide - TMS
5 N-Ethyl-2-phenyl-N-(pyridin-4-ylmethyl)-3-[(trimethylsilyl)oxy]propanamide
6 Bromantane AC
7 Bromantane PRO
8 Bromantane TFA
9 Bromantane PFP

4. Спектры из списка новых потенциально опасных, из запроса , взятые из открытых источников и отсутствовавшие в библиотеке:
1 25H-NBOMe
1 25D-NB-4-OMe
2 25E-NBOMe
3 25G-NBOMe
4 25D-NBOMe
5 MN-25
6 MN-25-2-methyl derivative
7 bk-2C-B


Буду благодарен Коллегам за выявленные ошибки и не точности!

Сообщение отредактировал alexlp - 8.03.2015 - 09:40

[Еленна]

А в какой библиотеке есть сибутрамин? Извините, не профессионал

[alexlp]

А в какой библиотеке есть сибутрамин? Извините, не профессионал

Во всех

[alexlp]

Пара слов о том, как из АМДИС переместить спектр для идентификации в АИПСИН:
1. Провести деконволюцию и идентификацию в АМДИС
2. Перегнать спектр интересующего компонента в НИСТсёч
3. Экспортировать из НИСТсёч спектр компонента в формате MSP
4. Открыть этот спектр в АИПСИН.

Да, длинная цепочка, но оно того стоит.

При более тщательном изучении пакета обновлений выяснилось, что новый масс-спектральный идентификатор не заменил старый, а дополнил.
Прежний идентификатор так же доступен и называется по прежнему "хромато-масс-спектральный идентификатор", и имеет иконку с изображением хроматограммы.

[alexlp]

Уважаемые Коллеги!

Небольшие дополнения и исправления:

1 AB-CHMINACA M4 (2'-OH), metyl- ### MMB-CHMINACA M4 (2'-OH) - добавлена структурная формула
2 PVP-M (HO-alkyl-oxo-) TMS - вновь внесенный метаболит PVP
3 MDMB-CHMICA ### MDMB-CHM - подкорректировано название
4 Phenobarbital 2ME - полезное дополнение
5 Diphenylamine, N-methyl- ### Benzenamine, N-methyl-N-phenyl- -метилированный Дифениламин

Буду благодарен Коллегам за выявленные ошибки и не точности!

[alexlp]

Уважаемые Коллеги!

Сводная библиотека пополнена спектрами метаболитов-маркеров MDMB-CHMICA в виде метильных и ТМС производных:

1 MDMB-CHMICA Marker M1 (COOH), methyl- ### ADB-CHMICA Marker M1 (COOH), methyl-
2 MDMB-CHMICA Marker M3 (COOH, HO-), methyl- ### ADB-CHMICA Marker M3 (COOH, HO-), methyl- ### [not confirmed]
3 MDMB-CHMICA Marker M3 (COOH, HO-), diTMS- ### ADB-CHMICA Marker M3 (COOH, HO-), diTMS- ### [not confirmed]
4 MDMB-CHMICA Marker M1 (COOH), TMS- ### ADB-CHMICA Marker M1 (COOH), TMS- ### [not confirmed]

Обращаю ваше внимание на тег [not confirmed].

Обсуждение темы http://www.sudmed.ru/index.php?showtopic=25710#entry207990

Буду благодарен Коллегам за выявленные ошибки и не точности!

Сообщение отредактировал alexlp - 29.03.2015 - 11:44

[Tatarin_116]

SWGDRUG MS Library Version 2.3 (April 1, 2015)

[alexlp]

SWGDRUG MS Library Version 2.3 (April 1, 2015)

Теперь и для АМДИСа https://www.dropbox.com/s/0gobhugxftkyqrh/S..._AMDIS.zip?dl=0

[alexlp]

Уважаемые Коллеги!

Очередная сборка сводной библиотеки SUDMED_2200_LIB_20150411.

Из нового - добавлены три спектра из последней версии rfdesdrugs, и два изомера маркера MDMB-CHMICA Marker M5 (Lactone, HO-).
Пересмотрена интерпретация спектров маркеров гидроксилированных MDMB(N)-Bz-F и MDMB-CHMICA в виде лактонов (как это происходит у UR-144|XLR11), за что огромное спасибо уважаемому Ludens!

1 MDMB-CHMICA Marker M5 (Lactone, HO-), isomer1 TMS- ### ADB-CHMICA Marker M5 (Lactone, HO-), isomer1 TMS- ### [not confirmed]
2 MDMB(N)-Bz-F Marker M2 (Lactone) ### ADB-FUBINACA Marker M2 (Lactone) ### [NOT CONFIRMED]
3 MDMB-CHMICA Marker M5 (Lactone, HO-), isomer1 ### ADB-CHMICA Marker M5 (Lactone, HO-), isomer1 ### [not confirmed]
4 MDMB-CHMICA Marker M5 (Lactone, HO-), isomer2 ### ADB-CHMICA Marker M5 (Lactone, HO-), isomer2 ### [not confirmed]
5 DMBA(O)-CHM ### [NOT CONFIRMED]
6 ?-PHexP
7 1-Phenyl-2-pyrrolidino-hex-2-en-1-one
8 5-DBFPV ### [NOT CONFIRMED]

Обращаю ваше внимание на тег [not confirmed].

Буду благодарен Коллегам за выявленные ошибки и не точности!

[KSS17]

Здравствуйте!
У нас первый случай отравления а-РНехР, пока несмертельного...
Спектры нативного, артефакта, метаболитов и индексы для НР-5 в архиве.
Как и с предыдущими версиями данной группы веществ оксо-метаболит имеет более характерный спектр, чем исходняк и окси-метаболит, а их совокупность в моче хороший идентификационный признак.

[alexlp]

Здравствуйте!
У нас первый случай отравления а-РНехР, пока несмертельного...
Спектры нативного, артефакта, метаболитов и индексы для НР-5 в архиве.
Как и с предыдущими версиями данной группы веществ оксо-метаболит имеет более характерный спектр, чем исходняк и окси-метаболит, а их совокупность в моче хороший идентификационный признак.

Здравствуйте!
И у нас идет эта гадость. Но у нас есть смертельный случай. Есть и у живых. Оксо - действительно неплох.

[alexlp]

Уважаемые Коллеги!

Очередная сборка сводной библиотеки SUDMED_2206_LIB_20150430.
Добавлены шесть спектров alfa-PHexP и его метаболитов в виде нативных соединений и ацетильных дериватов, предствленных уважаемым KSS17.

1 a-PHexP # a-pyrrolidinohexanophenone # a-pyrrolidinohexiophenone # 1-phenyl-2-pyrrolidin-1-ylhexan-1-one
2 a-PHexP artifact # a-pyrrolidinohexiophenone artifact # 1-phenyl-2-pyrrolidin-1-ylhex-2-en-1-one
3 a-PHexP-M (OH) # 1-phenyl-2-pyrrolidin-1-ylhexan-1-ol
4 a-PHexP-M (oxo) # 1-(1-benzoylpentyl)pyrrolidin-2-one
5 a-PHexP-M (bis-nor), N-acetyl- # N-(1-benzoylpentyl)-acetamide
6 a-PHexP-M (OH), O-acetyl- # 1-phenyl-2-pyrrolidin-1-ylhexyl acetate

Буду благодарен Коллегам за выявленные ошибки и не точности!

Сообщение отредактировал alexlp - 3.05.2015 - 11:59

[alexlp]

Уважаемые Коллеги!

Очередная сборка сводной библиотеки SUDMED_2208_LIB_20150510.
Полезное дополнение: моно- и ди- метильные дериваты 11-Nor-δ-9-tetrahydrocannabinol-9-carboxylic acid.
Особенно полезны при метилировании с помощью метилйодида с безводным карбонатом в ацетоне.

1 d9-THC M1 (-COOCH3,-OCH3) 2ME
2 d9-THC M2 (-COOCH3, -OH) ME

Буду благодарен Коллегам за выявленные ошибки и не точности!