Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

Форум судебных медиков России
41 страниц V « < 34 35 36 37 38 > »   
>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
alexlp
сообщение 16.06.2008 - 21:41
Сообщение #1 (закреплено)


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д.
Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip).

Загрузить полный пакет библиотек вы можете как со страницы форума, так и с нового сайта проекта http://sudmed-ms.my1.ru/

SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ

sudmed-ms_2832_amdislib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке.

sudmed-ms_2832_nistlib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь.

SUDMED-MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation)

sudmed-ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary - библиотека в формате Agilent MassHunter

sudmed-ms_2832_lib_20191231.pdf - индексный список содержимого библиотеки

SUDMED-MS_2832_LIB_20191231_new.pdf - сведения об обновлениях

SUDMED_MS_SETUP.pdf - инструкция по установке библиотек SUDMED-MS

Сообщение отредактировал KSS17 - 1.01.2020 - 18:35


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_NNCN_20141108_2.zip ( 14.45 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  4034
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_MS_SETUP.pdf ( 404.04 килобайт ) Кол-во скачиваний:  1000
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231.pdf ( 634.57 килобайт ) Кол-во скачиваний:  807
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_amdislib_20191231.zip ( 1.16 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  625
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip ( 1.11 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  539
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_nistlib_20191231.zip ( 2.61 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  595
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary.zip ( 1.02 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  556
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231_NEW.pdf ( 245.63 килобайт ) Кол-во скачиваний:  837
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231_eng.pdf ( 581.64 килобайт ) Кол-во скачиваний:  848
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
Korvet
сообщение 1.07.2016 - 07:54
Сообщение #526


Магистр форума

Группа: СМЭ
Регистрация: 13.05.2009
Из: Томск
Пользователь №: 14 703


Всем добрый день!
у нас кажется новинки. предположительно
фтор-пирролидингексанофенон

и N-этильный аналог бутилона.

Во вложении msp с тремя спектрами (фтор-пирролидингексанофенон, N-метильный аналог бутилона и его ацетильное производное ) и их RI. А также хроматограмма со всеми тремя. Малость перегрузил, видать забыл уж как с нативами работать!

Судебная медицина - Прикрепленный файл  NEW_BY1.D.rar ( 1.12 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  280


Сообщение отредактировал Korvet - 1.07.2016 - 07:55
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Korvet
сообщение 4.07.2016 - 03:22
Сообщение #527


Магистр форума

Группа: СМЭ
Регистрация: 13.05.2009
Из: Томск
Пользователь №: 14 703


ой, тысяча извинений. не N-метильный аналог бутилона, а N-этильный аналог бутилона, то есть вместо метильной группы при азоте - этильная.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KNIISE
сообщение 19.07.2016 - 10:19
Сообщение #528


Продвинутый участник

Группа: Участники
Регистрация: 16.03.2010
Пользователь №: 20 614


Обновилась SWGDRUG - MS Library Version 3.0 (July 14, 2016)
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 8.08.2016 - 00:11
Сообщение #529


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Свежая SWGDRUG теперь и для AMDIS: https://1drv.ms/u/s!AnEB5e3EPZhjhf9SY5Im6YW70XXS0A
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
АМД
сообщение 15.08.2016 - 20:14
Сообщение #530


Опытный участник

Группа: Химики-аналитики
Регистрация: 12.01.2011
Пользователь №: 24 970


[Уважаемые коллеги, подскажите пожалуйста, как эту библиотеку SWGDRUG установить, чтобы она работала с AMDIS? Я пробовал но ничего не получилось.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 16.08.2016 - 00:17
Сообщение #531


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(АМД @ 15.08.2016 - 22:14)
[Уважаемые коллеги, подскажите пожалуйста, как эту библиотеку SWGDRUG установить, чтобы она работала с AMDIS? Я пробовал но ничего не получилось.

А в чем проблема?
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
АМД
сообщение 16.08.2016 - 13:45
Сообщение #532


Опытный участник

Группа: Химики-аналитики
Регистрация: 12.01.2011
Пользователь №: 24 970


я пытался распаковать файл, который для АМДИС, но выскакивает сообщение "не удалось открыть этот пакет исправлений". Что именно нужно сделать с этим файлом? На комне стоит АМДИС, в нем есть старая библиотека SWGDRUG А этот файл это обновление или новая библиотека?
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 16.08.2016 - 14:10
Сообщение #533


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(АМД @ 16.08.2016 - 15:45)
я пытался распаковать файл, который для АМДИС, но выскакивает сообщение "не удалось открыть этот пакет исправлений". Что именно нужно сделать с этим файлом? На комне стоит АМДИС, в нем есть старая библиотека SWGDRUG А этот файл это обновление или новая библиотека?

Не нужно запускать MSP файл! Положите его к библиотекам АМДИСа и подключите как целевую библиотеку.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
АМД
сообщение 16.08.2016 - 15:26
Сообщение #534


Опытный участник

Группа: Химики-аналитики
Регистрация: 12.01.2011
Пользователь №: 24 970


То есть этот файл положить в папку там где старый SWGDRUG и sudmed и проделать такую же процедуру как в инструкции для библиотеки sudmed? Приношу свои извинения за такие элементарные вопросы, но я это делаю в первый раз. При настройке ГХМС нам все это сделал инженер, при этом он делал все так быстро, что я не успел проследить за действиями и записать
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
zavlab
сообщение 16.08.2016 - 16:15
Сообщение #535


Участник форума

Группа: Химики-аналитики
Регистрация: 6.06.2009
Из: Могилев
Пользователь №: 15 240


Файл swgdrug_amdis_20160714.MSP поместить по пути диск:\nist14\amdis32\LIB\, затем в программе амдис 32 как обычно выбрать библиотеку: Analisys\setting\libr\select new
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 7.11.2016 - 11:38
Сообщение #536


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Уважаемые Коллеги!

Очередная сборка сводной библиотеки SUDMED_2301_LIB_20161106:

1. Самое главное - в библиотеку включены новые позиции нового СК APINAC ### AKB-57 и спектры его метаболитов в виде ТМС-производных.
Хочу обратить внимание Коллег, что APINAC - это очередной карбоксилат, который в в виде целой молекулы в моче не обнаруживается.
Для доказательства его обнаружения необходимо доказать присутствие пентилиндазольной кислоты и ее метаболитов и адамантанола и его метаболитов.
Пентилиндазольная кислота внесена в библиотеку в следующих позициях:
AB-PINACA-M6 (3-COOH), methyl-
APINAC-M (HY) TMS ### AB-PINACA-M6 (3-COOH), TMS-

1-Адамантанол и его метаболиты внесена в библиотеку в следующих позициях:
1-adamantol-M (HO-) isomer 2 2TMS ### APINAC-M5 (HY) 2TMS- ### ACBL(N)-018-M5 (HY) 2TMS-
1-adamantol-M (HO-) isomer 1 2TMS ### APINAC-M4 (HY) 2TMS- ### ACBL(N)-018-M4 (HY) 2TMS-
1-adamantol-M (HO-) 2TMS ### APINAC-M3 (HY) 2TMS- ### ACBL(N)-018-M3 (HY) 2TMS-
1-adamantol ### APINAC-M2 (HY) ### ACBL(N)-018-M2 (HY)
1-adamantol TMS ### APINAC-M2 (HY) TMS- ### ACBL(N)-018-M2 (HY) TMS-


Так же внесены спектры новинок 2C-B-M, 2C-I-M, N-ethylbutylon (acetyl), N-ethylbutylon, 4F-PHP, а так же спектры из публикаций этого года.
Дополнен так же список классики.
Всего библиотека пополнилась на 39 позиций:

1 MMB-CHMICA
2 MDMB-CHMICA Marker M1.1 (COOH), methyl- ### ADB-CHMICA Marker M1.1 (COOH), methyl-
3 MDMB-CHMICA Marker M1.1 (COOH), TMS- ### ADB-CHMICA Marker M1.1 (COOH), TMS-
4 MDMB-CHMICA Marker M2.1 (COOH, HO-), 2TMS- ### ADB-CHMICA Marker M2.1 (COOH, HO-), 2TMS-
5 MDMB-CHMICA Marker M2.2 (COOH, HO-), 2TMS- ### ADB-CHMICA Marker M2.2 (COOH, HO-), 2TMS-
6 MDMB-CHMICA Marker M2.3 (COOH, HO-), 2TMS- ### ADB-CHMICA Marker M2.3 (COOH, HO-), 2TMS-
7 MDMB-CHMICA Marker M3.1 (COOH, 2HO-), 3TMS- ### ADB-CHMICA Marker M3.1 (COOH, 2HO-), 3TMS-
8 MDMB-CHMICA Marker M4.1 (Lactone, HO-), isomer1 TMS- ### ADB-CHMICA Marker M4.1 (Lactone, HO-), isomer1 TMS-
9 MDMB-CHMICA Marker M4.2 (Lactone, HO-), isomer2 TMS- ### ADB-CHMICA Marker M4.2 (Lactone, HO-), isomer2 TMS-
10 MDMB-CHMICA Marker M4.3 (Lactone, HO-), isomer3 TMS- ### ADB-CHMICA Marker M4.3 (Lactone, HO-), isomer3 TMS-
11 MDMB(N)-2201-M3 (2COOH), dimethyl- ### [NOT CONFIRMED]
12 Naproxen ME
13 Doxylamine
14 Thymine
15 α-Pyrrolidinopropiophenone
16 Propofol-M (Chinone: 2,6-Di-iso-propylbenzoquinone)
17 Propofol-M (2,6-Di-iso-Propyl-1,4-benzenediole)
18 Propofol-M (OH Ring: p-Hydroxy-6-acetyl-2-iso-propyl-phenol)
19 Phenobarbital-M (HO-)
20 Tramadol-M/A (Nor,-H2O) TFA
21 APINAC ### AKB-57 ### AKB57 ### ACBL(N)-018 # Adamantyl-1-pentyl-1H-indazole-3-carboxylate
22 1-adamantol-M (HO-) isomer 2 2TMS ### APINAC-M5 (HY) 2TMS- ### ACBL(N)-018-M5 (HY) 2TMS-
23 1-adamantol-M (HO-) isomer 1 2TMS ### APINAC-M4 (HY) 2TMS- ### ACBL(N)-018-M4 (HY) 2TMS-
24 1-adamantol-M (HO-) 2TMS ### APINAC-M3 (HY) 2TMS- ### ACBL(N)-018-M3 (HY) 2TMS-
25 1-adamantol ### APINAC-M2 (HY) ### ACBL(N)-018-M2 (HY)
26 1-adamantol TMS ### APINAC-M2 (HY) TMS- ### ACBL(N)-018-M2 (HY) TMS-
27 APINAC-M (HY) TMS ### AB-PINACA-M6 (3-COOH), TMS-
28 APINAC ### AKB-57 ### ACBL(N)-018

29 2C-B-M (desamino, COOH), methyl- # methyl (4-bromo-2,5-dimethoxyphenyl)acetate
30 2C-I-M (desamino-HOOC-), ME # methyl (4-iodo-2,5-dimethoxyphenyl)acetate
31 N-ethylbutylon (acetyl)
32 N-ethylbutylon
33 4F-PHP
34 MDEA TMS ### N-Ethyl-3,4-methylenedioxyamphetamine TMS
35 2,3-MBDB TMS ### N-Methyl-1-(3,4-methylenedioxyphenyl)butan-2-amine TMS
36 MDMA TMS ### 3,4-Methylenedioxymethamphetamine TMS
37 MDA TMS ### 3,4-Methylenedioxyamphetamine TMS
38 2,3-MBDB TFA ### N-Methyl-1-(2,3-methylenedioxyphenyl)butan-2-amine TFA
39 MDEA TFA ### N-Ethyl-2,3-methylenedioxyamphetamine TFA


2. Часть позиций переименована для приведения в соответствие с форматом проекта, а 25 позиций удалены, как не соответствующие критериям проекта.
3. Введен еще один формат представления библиотеки:
SUDMED_2301_MSHUNLIB_20161106.mslibrary.xml - библиотека в формате Agilent MassHunter

Буду искренне благодарен за выявленные ошибки и не точности в библиотеке!
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KNIISE
сообщение 21.11.2016 - 19:31
Сообщение #537


Продвинутый участник

Группа: Участники
Регистрация: 16.03.2010
Пользователь №: 20 614


mzCloud is an extensively curated database of high-resolution tandem mass spectra, Supported Operating Systems: Microsoft Windows =,> 7.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 21.11.2016 - 19:44
Сообщение #538


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(KNIISE @ 21.11.2016 - 21:31)
mzCloud is an extensively curated database of high-resolution tandem mass spectra, Supported Operating Systems: Microsoft Windows =,> 7.


СУПЕР!!!!
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Korvet
сообщение 22.11.2016 - 05:33
Сообщение #539


Магистр форума

Группа: СМЭ
Регистрация: 13.05.2009
Из: Томск
Пользователь №: 14 703


Цитата(alexlp @ 21.11.2016 - 19:44)
СУПЕР!!!!


Присоединяюсь! здоровский сервис...кстати спайсики тоже есть.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 22.11.2016 - 18:32
Сообщение #540


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(KNIISE @ 21.11.2016 - 21:31)
mzCloud is an extensively curated database of high-resolution tandem mass spectra, Supported Operating Systems: Microsoft Windows =,> 7.

Обращаю внимание на то, что сервис работает только при наличии SilverLight и только в IE и Ferefox. Также можно установить его как отдельное приложение через правую кнопку мыши.
Действительно, есть актуальные карбоксамиды, например AB-FUBINACA, ADB-FUBINACA и т.п.

https://www.youtube.com/watch?v=kZixALkTiuk

Сообщение отредактировал alexlp - 22.11.2016 - 18:35
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

41 страниц V « < 34 35 36 37 38 > » 



- Обратная связь Сейчас: 15.01.2025 - 19:05