Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )
Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных |
alexlp |
16.06.2008 - 21:41
Сообщение
#1 (закреплено) |
Мастер II Группа: СМЭ Регистрация: 14.06.2008 Пользователь №: 8 835 |
Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д. Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip). Загрузить полный пакет библиотек вы можете как со страницы форума, так и с нового сайта проекта SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ sudmed-ms_2832_amdislib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке. sudmed-ms_2832_nistlib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь. SUDMED-MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation) sudmed-ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary - библиотека в формате Agilent MassHunter sudmed-ms_2832_lib_20191231.pdf - индексный список содержимого библиотеки SUDMED-MS_2832_LIB_20191231_new.pdf - сведения об обновлениях SUDMED_MS_SETUP.pdf - инструкция по установке библиотек SUDMED-MS Прикрепленные файлы SUDMED_NNCN_20141108_2.zip ( 14.45 мегабайт ) Кол-во скачиваний: 4034 SUDMED_MS_SETUP.pdf ( 404.04 килобайт ) Кол-во скачиваний: 1000 sudmed_ms_2832_lib_20191231.pdf ( 634.57 килобайт ) Кол-во скачиваний: 807 sudmed_ms_2832_amdislib_20191231.zip ( 1.16 мегабайт ) Кол-во скачиваний: 625 SUDMED_MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip ( 1.11 мегабайт ) Кол-во скачиваний: 539 sudmed_ms_2832_nistlib_20191231.zip ( 2.61 мегабайт ) Кол-во скачиваний: 595 sudmed_ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary.zip ( 1.02 мегабайт ) Кол-во скачиваний: 556 sudmed_ms_2832_lib_20191231_NEW.pdf ( 245.63 килобайт ) Кол-во скачиваний: 837 sudmed_ms_2832_lib_20191231_eng.pdf ( 581.64 килобайт ) Кол-во скачиваний: 848 |
Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных |
Korvet |
1.07.2016 - 07:54
Сообщение
#526 |
Магистр форума Группа: СМЭ Регистрация: 13.05.2009 Из: Томск Пользователь №: 14 703 |
Всем добрый день!
у нас кажется новинки. предположительно фтор-пирролидингексанофенон и N-этильный аналог бутилона. Во вложении msp с тремя спектрами (фтор-пирролидингексанофенон, N-метильный аналог бутилона и его ацетильное производное ) и их RI. А также хроматограмма со всеми тремя. Малость перегрузил, видать забыл уж как с нативами работать! NEW_BY1.D.rar ( 1.12 мегабайт ) Кол-во скачиваний: 280 |
Korvet |
4.07.2016 - 03:22
Сообщение
#527 |
Магистр форума Группа: СМЭ Регистрация: 13.05.2009 Из: Томск Пользователь №: 14 703 |
ой, тысяча извинений. не N-метильный аналог бутилона, а N-этильный аналог бутилона, то есть вместо метильной группы при азоте - этильная.
|
KNIISE |
19.07.2016 - 10:19
Сообщение
#528 |
Продвинутый участник Группа: Участники Регистрация: 16.03.2010 Пользователь №: 20 614 |
|
alexlp |
8.08.2016 - 00:11
Сообщение
#529 |
Мастер II Группа: СМЭ Регистрация: 14.06.2008 Пользователь №: 8 835 |
Свежая SWGDRUG теперь и для AMDIS:
|
АМД |
15.08.2016 - 20:14
Сообщение
#530 |
Опытный участник Группа: Химики-аналитики Регистрация: 12.01.2011 Пользователь №: 24 970 |
[Уважаемые коллеги, подскажите пожалуйста, как эту библиотеку SWGDRUG установить, чтобы она работала с AMDIS? Я пробовал но ничего не получилось.
|
alexlp |
16.08.2016 - 00:17
Сообщение
#531 |
Мастер II Группа: СМЭ Регистрация: 14.06.2008 Пользователь №: 8 835 |
|
АМД |
16.08.2016 - 13:45
Сообщение
#532 |
Опытный участник Группа: Химики-аналитики Регистрация: 12.01.2011 Пользователь №: 24 970 |
я пытался распаковать файл, который для АМДИС, но выскакивает сообщение "не удалось открыть этот пакет исправлений". Что именно нужно сделать с этим файлом? На комне стоит АМДИС, в нем есть старая библиотека SWGDRUG А этот файл это обновление или новая библиотека?
|
alexlp |
16.08.2016 - 14:10
Сообщение
#533 |
Мастер II Группа: СМЭ Регистрация: 14.06.2008 Пользователь №: 8 835 |
я пытался распаковать файл, который для АМДИС, но выскакивает сообщение "не удалось открыть этот пакет исправлений". Что именно нужно сделать с этим файлом? На комне стоит АМДИС, в нем есть старая библиотека SWGDRUG А этот файл это обновление или новая библиотека? Не нужно запускать MSP файл! Положите его к библиотекам АМДИСа и подключите как целевую библиотеку. |
АМД |
16.08.2016 - 15:26
Сообщение
#534 |
Опытный участник Группа: Химики-аналитики Регистрация: 12.01.2011 Пользователь №: 24 970 |
То есть этот файл положить в папку там где старый SWGDRUG и sudmed и проделать такую же процедуру как в инструкции для библиотеки sudmed? Приношу свои извинения за такие элементарные вопросы, но я это делаю в первый раз. При настройке ГХМС нам все это сделал инженер, при этом он делал все так быстро, что я не успел проследить за действиями и записать
|
zavlab |
16.08.2016 - 16:15
Сообщение
#535 |
Участник форума Группа: Химики-аналитики Регистрация: 6.06.2009 Из: Могилев Пользователь №: 15 240 |
Файл swgdrug_amdis_20160714.MSP поместить по пути диск:\nist14\amdis32\LIB\, затем в программе амдис 32 как обычно выбрать библиотеку: Analisys\setting\libr\select new
|
alexlp |
7.11.2016 - 11:38
Сообщение
#536 |
Мастер II Группа: СМЭ Регистрация: 14.06.2008 Пользователь №: 8 835 |
Уважаемые Коллеги!
Очередная сборка сводной библиотеки SUDMED_2301_LIB_20161106: 1. Самое главное - в библиотеку включены новые позиции нового СК APINAC ### AKB-57 и спектры его метаболитов в виде ТМС-производных. Хочу обратить внимание Коллег, что APINAC - это очередной карбоксилат, который в в виде целой молекулы в моче не обнаруживается. Для доказательства его обнаружения необходимо доказать присутствие пентилиндазольной кислоты и ее метаболитов и адамантанола и его метаболитов. Пентилиндазольная кислота внесена в библиотеку в следующих позициях: AB-PINACA-M6 (3-COOH), methyl- APINAC-M (HY) TMS ### AB-PINACA-M6 (3-COOH), TMS- 1-Адамантанол и его метаболиты внесена в библиотеку в следующих позициях: 1-adamantol-M (HO-) isomer 2 2TMS ### APINAC-M5 (HY) 2TMS- ### ACBL(N)-018-M5 (HY) 2TMS- 1-adamantol-M (HO-) isomer 1 2TMS ### APINAC-M4 (HY) 2TMS- ### ACBL(N)-018-M4 (HY) 2TMS- 1-adamantol-M (HO-) 2TMS ### APINAC-M3 (HY) 2TMS- ### ACBL(N)-018-M3 (HY) 2TMS- 1-adamantol ### APINAC-M2 (HY) ### ACBL(N)-018-M2 (HY) 1-adamantol TMS ### APINAC-M2 (HY) TMS- ### ACBL(N)-018-M2 (HY) TMS- Так же внесены спектры новинок 2C-B-M, 2C-I-M, N-ethylbutylon (acetyl), N-ethylbutylon, 4F-PHP, а так же спектры из публикаций этого года. Дополнен так же список классики. Всего библиотека пополнилась на 39 позиций: 1 MMB-CHMICA 2 MDMB-CHMICA Marker M1.1 (COOH), methyl- ### ADB-CHMICA Marker M1.1 (COOH), methyl- 3 MDMB-CHMICA Marker M1.1 (COOH), TMS- ### ADB-CHMICA Marker M1.1 (COOH), TMS- 4 MDMB-CHMICA Marker M2.1 (COOH, HO-), 2TMS- ### ADB-CHMICA Marker M2.1 (COOH, HO-), 2TMS- 5 MDMB-CHMICA Marker M2.2 (COOH, HO-), 2TMS- ### ADB-CHMICA Marker M2.2 (COOH, HO-), 2TMS- 6 MDMB-CHMICA Marker M2.3 (COOH, HO-), 2TMS- ### ADB-CHMICA Marker M2.3 (COOH, HO-), 2TMS- 7 MDMB-CHMICA Marker M3.1 (COOH, 2HO-), 3TMS- ### ADB-CHMICA Marker M3.1 (COOH, 2HO-), 3TMS- 8 MDMB-CHMICA Marker M4.1 (Lactone, HO-), isomer1 TMS- ### ADB-CHMICA Marker M4.1 (Lactone, HO-), isomer1 TMS- 9 MDMB-CHMICA Marker M4.2 (Lactone, HO-), isomer2 TMS- ### ADB-CHMICA Marker M4.2 (Lactone, HO-), isomer2 TMS- 10 MDMB-CHMICA Marker M4.3 (Lactone, HO-), isomer3 TMS- ### ADB-CHMICA Marker M4.3 (Lactone, HO-), isomer3 TMS- 11 MDMB(N)-2201-M3 (2COOH), dimethyl- ### [NOT CONFIRMED] 12 Naproxen ME 13 Doxylamine 14 Thymine 15 α-Pyrrolidinopropiophenone 16 Propofol-M (Chinone: 2,6-Di-iso-propylbenzoquinone) 17 Propofol-M (2,6-Di-iso-Propyl-1,4-benzenediole) 18 Propofol-M (OH Ring: p-Hydroxy-6-acetyl-2-iso-propyl-phenol) 19 Phenobarbital-M (HO-) 20 Tramadol-M/A (Nor,-H2O) TFA 21 APINAC ### AKB-57 ### AKB57 ### ACBL(N)-018 # Adamantyl-1-pentyl-1H-indazole-3-carboxylate 22 1-adamantol-M (HO-) isomer 2 2TMS ### APINAC-M5 (HY) 2TMS- ### ACBL(N)-018-M5 (HY) 2TMS- 23 1-adamantol-M (HO-) isomer 1 2TMS ### APINAC-M4 (HY) 2TMS- ### ACBL(N)-018-M4 (HY) 2TMS- 24 1-adamantol-M (HO-) 2TMS ### APINAC-M3 (HY) 2TMS- ### ACBL(N)-018-M3 (HY) 2TMS- 25 1-adamantol ### APINAC-M2 (HY) ### ACBL(N)-018-M2 (HY) 26 1-adamantol TMS ### APINAC-M2 (HY) TMS- ### ACBL(N)-018-M2 (HY) TMS- 27 APINAC-M (HY) TMS ### AB-PINACA-M6 (3-COOH), TMS- 28 APINAC ### AKB-57 ### ACBL(N)-018 29 2C-B-M (desamino, COOH), methyl- # methyl (4-bromo-2,5-dimethoxyphenyl)acetate 30 2C-I-M (desamino-HOOC-), ME # methyl (4-iodo-2,5-dimethoxyphenyl)acetate 31 N-ethylbutylon (acetyl) 32 N-ethylbutylon 33 4F-PHP 34 MDEA TMS ### N-Ethyl-3,4-methylenedioxyamphetamine TMS 35 2,3-MBDB TMS ### N-Methyl-1-(3,4-methylenedioxyphenyl)butan-2-amine TMS 36 MDMA TMS ### 3,4-Methylenedioxymethamphetamine TMS 37 MDA TMS ### 3,4-Methylenedioxyamphetamine TMS 38 2,3-MBDB TFA ### N-Methyl-1-(2,3-methylenedioxyphenyl)butan-2-amine TFA 39 MDEA TFA ### N-Ethyl-2,3-methylenedioxyamphetamine TFA 2. Часть позиций переименована для приведения в соответствие с форматом проекта, а 25 позиций удалены, как не соответствующие критериям проекта. 3. Введен еще один формат представления библиотеки: SUDMED_2301_MSHUNLIB_20161106.mslibrary.xml - библиотека в формате Agilent MassHunter Буду искренне благодарен за выявленные ошибки и не точности в библиотеке! |
KNIISE |
21.11.2016 - 19:31
Сообщение
#537 |
Продвинутый участник Группа: Участники Регистрация: 16.03.2010 Пользователь №: 20 614 |
|
alexlp |
21.11.2016 - 19:44
Сообщение
#538 |
Мастер II Группа: СМЭ Регистрация: 14.06.2008 Пользователь №: 8 835 |
СУПЕР!!!! |
Korvet |
22.11.2016 - 05:33
Сообщение
#539 |
Магистр форума Группа: СМЭ Регистрация: 13.05.2009 Из: Томск Пользователь №: 14 703 |
|
alexlp |
22.11.2016 - 18:32
Сообщение
#540 |
Мастер II Группа: СМЭ Регистрация: 14.06.2008 Пользователь №: 8 835 |
Обращаю внимание на то, что сервис работает только при наличии SilverLight и только в IE и Ferefox. Также можно установить его как отдельное приложение через правую кнопку мыши. Действительно, есть актуальные карбоксамиды, например AB-FUBINACA, ADB-FUBINACA и т.п. |
Сейчас: 15.01.2025 - 19:05 |